Equipe 2MAP : Mécanismes Moléculaires d’Adaptation et de Plasticité

Approches intégratives visant à caractériser les mécanismes moléculaires d’interaction des hôtes vis à vis de leurs pathogènes sous influence environnementale

Dans l’équipe 2MAP, nous caractérisons les processus cellulaires et moléculaires impliqués dans les interactions hôte / symbiote / pathogène pour comprendre l’adaptation des organismes hôtes. Nous étudions en particulier les mécanismes immunitaires de l’hôte et leur plasticité face aux contraintes biotiques et abiotiques. Afin d’atteindre ces objectifs, nous travaillons sur des systèmes expérimentaux animaux simplifiés en utilisant des génotypes sélectionnés aux phénotypes contrastés. Nous travaillons sur des modèles invertébrés d’intérêt économique et en santé humaine et animale, pour étudier des maladies d’étiologie complexe. Nous utilisons et intégrons des approches «omiques», comme la génomique, la transcriptomique, et l’épigénomique, et également des méthodes de biologie fonctionnelle, comme la transgénèse ou l’invalidation de gènes.

L’équipe 2MAP est organisée en 3 axes :

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Axe 1: Mécanismes moléculaires de la dynamique co-évolutiveAxe 2. Systèmes de défense de l’hôte: équilibre entre coût et fitnessAxe 3. Vers une vision unifiée de la mémoire immunitaire innée chez les invertébrés
Les pressions de sélection entre les hôtes et leurs parasites peuvent entraîner une évolution réciproque ou une adaptation de traits d’histoire de vie spécifiques de ces protagonistes. Cette coévolution entre hôtes et parasites devrait entraîner des variations de l'infectivité / virulence des parasites et de la défense / réponse immunitaire des hôtes. L'analyse des déterminants moléculaires impliqués dans ces interactions est toutefois peu étudiée. Ainsi, les modèles biologiques actuels dans ce conteste de dynamique coévolutive doivent être revus et nourris de connaissances nouvelles et plus détaillées sur les mécanismes moléculaires sous-jacents. En utilisant nos modèles invertébrés d'importance écologique et économique et des pédigrées générés en laboratoire, nous développons des approches «omiques» intégratives pour déchiffrer les bases moléculaires de la compatibilité hôte/parasite.La compréhension des interactions entre l’hôte, les pathogènes et l’environnement dans un contexte de maladies infectieuses est d’importance majeure pour contrôler et prédire les risques épidémiologiques. En focalisant sur le système de défense, nous voulons identifier des déterminants de la sensibilité et la résistance des hôtes (ie. déterminants transcriptomiques validés fonctionnellement) aux maladies infectieuses touchant nos modèles d’invertébrés. Du fait que développer une résistance représente un cout pour l’organisme, une attention particulière est portée sur les « trade-offs » de cette résistance sur d’autres traits d’intérêts (fécondité, grossissement, résistance à d’autres maladies infectieuses…). Ces travaux prennent également en compte des contraintes environnementales affectant nos modèles d’invertébré, comme par exemple les variations de température ou d’apports alimentaires.Tous les organismes vivants ont développé des systèmes de défense capables de reconnaître et de contrôler / contenir et / ou d’éliminer la plupart des agents pathogènes rencontrés au cours de leur vie. Au cours des deux dernières décennies, un nombre croissant d’études sur les procaryotes, les plantes et les invertébrés ont démontré que ces organismes étaient capables de mettre en œuvre une réponse immunitaire acquise (améliorée) qui peut être spécifique et durable, les protégeant ainsi contre les infections ultérieures (mémoire immunitaire innée, IIM). Nous étudions l’existence de l’IIM chez les invertébrés en utilisant des approches moléculaires et cellulaires intégratives et comparatives de pointe dans le but de réconcilier la phénoménologie avec les mécanismes et de revisiter la dichotomie artificielle entre l’immunité innée et l’immunité adaptative.


Responsables :
GOURBAL Benjamin, Maître de conférence Univ. Perpignan
BOULO Viviane, Chercheuse Ifremer

Personnel permanent :
DUVAL David, Professeur UPVD
GALINIER Richard, Ingénieur de recherches CNRS
GRUNAU Christoph, Professeur Univ. Perpignan
MITTA Guillaume, Professeur Univ. Perpignan
VIGNAL Emmanuel, Maître de conférences Univ. Montpellier

Personnel non permanent :
BOISMORAND Louis, Doctorant Univ. Perpignan
GIRAUD Carolane, Doctorante – Nouvelle Calédonie
PICHON Rémi, Doctorant Univ. Perpignan
POTEAUX Pierre, Doctorant Univ. Perpignan
SIMPHOR Elodie, Doctorante Univ. Perpignan

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Internationaux

WELLCOME TRUST : FUGI (2018-2022) Functional Genomics of Flatworms
Porteur de projet : Karl Hoffmann
Responsable scientifique IHPE : Christoph Grunau
Partenaires : Aberystwyth University UKWellcome Sanger Institute UK  /  University of Würzburg Allemagne  /  George Washington University USA  /  UT Southwestern Medical Center USA  /  University of Giessen Allemagne  /  Cambridge Stem Cell Institute UK

CNRS PRC : HEMOPUL (2020-2023) Etude de l’hématopoïèse des Gastéropodes pulmonés
Porteur de projet : Benjamin Gourbal
Responsable scientifique IHPE : Benjamin Gourbal
Partenaires : Université de St Pétersburg, Russie

FAPESP : EPICURE (2019-2020) Assessing the EPIgenetic changes in Schistosoma mansoni developmental trajectory after in-vitro treatment with serum from schistosomiasis se.f-CUREd macaques
Porteur de projet : Sergio Verjovski-Almeida
Responsable scientifique IHPE : Christoph Grunau
Partenaires : Butantan Institute Brésil

Nationaux

ANR : AEROSNAIL (2020-2024) Structure Fonction des Biomphalysines. Identification des partenaires et récepteurs des Biomphalysines
Porteur de projet : David Duval
Responsable scientifique IHPE : David Duval
Partenaires :  IPBS Toulouse  /  LIEC Nancy

ANR : DECICOMP (2019-2024) Deciphering the whole complexity of the Pacific oyster mortality syndrome for modeling epidemiological risk
Porteur de projet : Guillaume Mitta
Responsable scientifique IHPE : Guillaume Mitta
Partenaires : IHPE, Equipe MIA IHPE, Equipe TREV PFOM Plouzané  /  LGPMM La Tremblade  /  LBI2M Roscoff MIVEGEC Montpellier

ANR : ADMIRE (2018-2022) Adaptation of Meloidogyne to host REsistance
Porteur de projet : Pierre Abad
Responsable scientifique IHPE : Christoph Grunau
Partenaires : Institut Sophia Agrobiotech Nice

Institutionnels

Labex CEMEB-ERJ : METABIOMPH (2021-2021) Métabolisme des hémocytes de Biomphalaria glabrata en réponse à une infestation par Schistosoma mansoni
Porteur de projet : Rémi Pichon
Responsable scientifique IHPE : Benjamin Gourbal
Partenaires :  HSM Montpellier  C3M Nice  /  Plateforme Métabolomique Montpellier

IFREMER POLITIQUE DE CENTRE : COMISTYL (2019-2021)  COmmunauté Microbienne et Immunité de STYLirostris
Porteur de projet : Nolwenn Callac
Responsable scientifique IHPE : Viviane Boulo
Partenaires : LEAD-NC Nouvelle-Calédonie  / Unité RMPF Polynésie Française

IFREMER : DEMOMYT (2020-2022) Décryptage de la maladie responsable des mortalités massives de moules
Porteur de projet : Guillaume Mitta
Responsable scientifique IHPE : Guillaume Mitta
Partenaires :  IHPE, Equipe MIALGPMM La Tremblade

Régionaux

Région Occitanie, Bourse de thèse : BIOSELECT (2020-2023) Caractérisation des facteurs de résistance dans l’interaction Biomphalaria / Schistosoma
Porteur de projet : David Duval
Responsable scientifique IHPE : David Duval
Partenaires : Oregon State University USA

Région Occitanie, Bourse de thèse : EPIPARA (2018-2021) Genie EPIgénétique: controle PARAsitaire avec des “armes” non-conventionnelles
Porteur de projet : Christoph Grunau
Responsable scientifique IHPE : Christoph Grunau
Partenaires : IHPE, Equipe TREV


mise à jour en cours

DISCLAIMER – Our group provides this data in good faith, but makes no warranty, express or implied, or assumes any legal liability or responsibility for any purpose that the data is used for.


MethDB:  the database for DNA methylation and environmental epigenetic effects.


PrimerDB:  the local oligonucleotide database (access restriction applies).


AntibodyDB:  the local antibody database (access restriction applies).


Local Galaxy Instance provides a graphical interface for bioinformatics analysis (access restriction applies)


SchistoGbrowse v2.54 genome browser for assembly version 5.2 (access restriction applies)


SnakeCharmer for selection of restriction enzymes for COmbined Bisulfite Restriiction Assay (COBRA)


MethTools analysis of bisulfite DNA methylation sequencing


EN COURS

Louis BOISMORAND (2023 Dir. Guillaume Mitta & Jérémie Vidal-Dupiol)
Comment la température et la nutrition contrôlent elles la susceptibilité des huîtres au syndrome de mortalité des huîtres du pacifique ?
Pierre POTEAUX (2023  Dir. David Duval & Benjamin Gourbal)
Caractérisation des facteurs immunitaires (Biomphalysines) dans la résistance au parasite Schistosoma chez Biomphalaria
Elodie SIMPHOR (2023 Dir. David Duval & Benjamin Gourbal)
Caractérisation des facteurs immunitaires dans la résistance au parasite Schistosoma chez Biomphalaria
Carolane GIRAUD (2022 Dir. Viviane Boulo)
Méta-analyses des communautés microbiennes de l’eau au lagon à l’élevage larvaire en lien avec les facteurs environnementaux
Rémi PICHON (2022 Dir. Benjamin Gourbal & Richard Galinier)
Aspects fonctionnel et évolutif de l’immunité mémoire chez l’escargot vecteur de la bilharziose intestinale Biomphalaria glabrata

SOUTENUES
Nelia LUVIANO
(2021 Dir. Christoph Grunau & Céline Cosseau)
La méthylation de l’ADN chez Biomphalaria glabrata, rôle et impact sur la transmission de la bilharziose.
Nelia est en post-doctorat au CRIOBE

Damien LASSALLE (2020 Dir. Benjamin Gourbal & David Duval)
Mécanismes d’action des Biomphalysines, de nouvelles cibles thérapeutiques contre la bilharziose.
Damien est business developer chez Samdoc

Manon FALLET (2019 Dir. Christoph Grunau & Céline Cosseau)
Etude de la réponse environnementale et transgénérationelle chez l’huître creuse Crassostrea gigas. Focus sur les mécanismes épigénétiques (le pdf sur HAL)
Manon est en post-doctorat au Man Technology Environment Research Centre de Örebro (Suède)

Camille HUOT (2019 Dir. David Duval & Eve Toulza)
Caractérisation et rôle, dans l’interaction tripartite, du microbiote d’hôtes intermédiaires Planorbidae des parasites trématodes Schistosoma spp., agents responsables de la bilharziose.

Annia ALBA (2018 Dir. Benjamin Gourbal & Antonio Vasquez)
Comparative biology of naturally resistant / susceptible Pseudosuccinea columella (Mollusca: Gastropoda) to Fasciola hepatica (Trematoda) infection in Cuba: ecological, molecular and phenotypical aspects (le pdf sur HAL )
Annia est en post-doctorat à MIVEGEC

Aude LUCASSON (2018 Dir. Julien De Lorgeril & Guillaume Mitta)
Caractérisation et diversité des mécanismes du syndrome de mortalité affectant les juvéniles de Crassostrea gigas (le pdf sur HAL )
Aude est responsable laboratoire autocontrôle pour Azura Aquaculture (Maroc)

Benoît ALIAGA (2018 Dir. Christoph Grunau & David Duval)
Comparaison des épigénomes des espèces non modèles (le pdf sur HAL )
Benoît est Ingénieur de Recherches à l’Université de Montpellier

Maxime LAFONT (2017 Dir. Benjamin Gourbal & Caroline Montagnani)
Mécanismes et spécificité du priming immunitaire antiviral chez un Lophotrochozoaire, l’huître creuse Crassostrea gigas ( le pdf sur HAL )
Maxime est Directeur Technique chez Bioceanor

Kelly BRENER-RAFFALLI (2017 Dir. Guillaume Mitta & Eve Toulza)
Dynamique de l’holobionte corallien et plasticité transcriptomique : variabilité interindividuelle, interpopulationnelle et interspécifique (le pdf  sur HAL)
Kelly est Conseillère Principale d’Education dans l’Education Nationale

Silvain PINAUD (2017 Dir. Guillaume Mitta & David Duval)
Aspects fonctionnels et évolutif de l’immunité mémoire chez les invertébrés : l’escargot vecteur de la Bilharziose intestinale Biomphalaria glabrata comme nouvel organisme modèle ? (le pdf sur HAL)
Sylvain est en post-doctorat au Cancer Research Cambridge Institute (UK)

Anaïs PORTET (2017 Dir. Benjamin Gourbal & Richard Galinier)
Décryptage du Polymorphisme de Compatibilité dans l’interaction entre Biomphalaria glabrata et Schistosoma mansoni : une approche intégrative (le pdf sur HAL )
Anaïs est en post-doctorat à l’Université de Cambridge (UK)

David ROQUIS (2015 Dir. Christoph Grunau & Céline Cosseau)
Contribution de l’épigénétique dans les  Dauermodifikations et l’évolution adaptative chez le  parasite humain Schistosoma mansoni et le corail  tropical Pocillopora damicornis (le pdf sur HAL)
David effectue son 3e post-doctorat, à Agroscope (Suisse)

portail de la collection depuis 2021
listing des publications depuis 2021
production des auteurs de l’équipe avant la création de celle-ci :

2021

Blanc, M., P. Antczak, X. Cousin, C. Grunau, N. Scherbak, J. Rüegg and S. H. Keiter (2021) The insecticide permethrin induces transgenerational behavioral changes linked to transcriptomic and epigenetic alterations in zebrafish (Danio rerio). Science of the Total Environment 779: 146404
DOI 10.1016/j.scitotenv.2021.146404 / HAL / Facteur d’impact 2019=6.551 / 5 ans=6.419 / Quartile 1 dans Environmental Sciences

De Carvalho Augusto, R., O. Rey, C. Cosseau, C. Chaparro, J. Vidal-Dupiol, J. F. Allienne, D. Duval, S. Pinaud, S. Tönges, R. Andriantsoa, E. Luquet, F. Aubret, M. Dia Sow, P. David, V. Thomson, D. Joly, M. Gomes Lima, D. Federico, E. Danchin, A. Minoda and C. Grunau (2021) A simple ATAC-seq protocol for population epigenetics [version 2; peer review: 2 approved]. Wellcome Open Research 5: 121 revised
DOI 10.12688/wellcomeopenres.15552.2 / HAL

Le Govic, Y., B. Gourbal and J. Boissier (2021) Booming omics in Schistosoma. Trends in Parasitology 37: 6-8
DOI 10.1016/j.pt.2020.10.010 / HAL / Facteur d’impact 2019=6.918 / 5 ans=7.352 / Quartile 1 dans Parasitology

Mouginot, P., N. Luviano Aparicio, D. Gourcilleau, M. Latutrie, S. Marin, J. L. Hemptinne, C. Grunau and B. Pujol (2021) Phenotypic response to light versus shade associated with DNA methylation changes in Snapdragon plants (Antirrhinum majus). Genes 12(2): 227
DOI 10.3390/genes12020227 / HAL / Facteur d’impact 2019=3.759 / 5 ans=3.822 / Quartile 2 dans Genetics & Heredity

Petton, B., D. Destoumieux-Garzόn, F. Pernet, E. Toulza, J. De Lorgeril, L. Degremont and G. Mitta (2021) The Pacific Oyster Mortality Syndrome, a polymicrobial and multifactorial disease: state of knowledge and future directions. Frontiers in Immunology 12: 630343
DOI 10.3389/fimmu.2021.630343 / HAL / Facteur d’impact 2019=5.085 / 5 ans=5.733 / Quartile 1 dans Immunology

Pinaud, S., G. Tetreau, P. Poteaux, R. Galinier, C. Chaparro, D. Lassalle, E. Simphor, B. Gourbal and D. Duval (2021 Provisionally accepted) New insights into biomphalysin gene family diversification in the vector snail Biomphalaria glabrata. Frontiers in Immunology.
DOI 10.3389/fimmu.2021.635131 / HAL/ Facteur d’impact 2019=5.085 / 5 ans=5.733 / Quartile 1 dans Immunology

Portet, A., R. Galinier, D. Lassalle, A. Faille, B. Gourbal and D. Duval (2021) Hemocyte siRNA uptake is increased by 5′ cholesterol-TEG addition in Biomphalaria glabrata, snail vector of schistosome. Peer Journal 9: e10895
DOI 10.7717/peerj.10895 / HAL / Facteur d’impact 2019=2.379 / 5 ans=2.81 / Quartile 2 dans Multidisciplinary Sciences

Richard, M., J. L. Rolland, Y. Gueguen, J. De Lorgeril, J. Pouzadoux, B. Mostajir, B. Bec, S. Mas, D. Parin, P. Le Gall, S. Mortreux, A. Fiandrino, F. Lagarde, G. Messiaen, M. Fortune and E. Roque D’Orbcastel (2021) In Situ Characterisation of Pathogen Dynamics during a Pacific Oyster Mortality Syndrome Episode. Marine Environmental Research 165: 105251.
DOI 10.1016/j.marenvres.2020.105251 / HAL / Facteur d’impact 2019=2.727 / 5 ans=3.496 / Quartile 1 dans Marine & Freswhater Biology  ; Quartile 2 dans Environmental Sciences ; Quartile 3 dans Toxicology

Stenger, P. L., C. L. Ky, C. Reisser, C. Cosseau, C. Grunau, M. Mege, S. Planes and J. Vidal-Dupiol (2021) Environmentally driver color variation in the pearl oster Pinctada margaritifera var. cumingii (Linnaeus, 1758) is associated with differential methylation of CpGs in pigment- and biomineralization-related genes. Frontiers in Genetics 12: 630290
DOI 10.3389/fgene.2021.630290 / HAL / Facteur d’impact 2019=3.260 / 5 ans=4.007 / Quartile 2 dans Genetics Heredity

2020

Alba A., Duval D., Sanchez J., Pérez A.B., Pinaud S., Galinier R., Vazquez A.A. and Gourbal B. (2020) The immunobiological interplay between Pseudosuccinea columella resistant/susceptible snails with Fasciola hepatica: hemocytes in the spotlight. Developmental and Comparative Immunology 102: 103485
DOI 10.1016/j.dci.2019.103485 / HAL / Facteur d’impact 2019=3.192 / 5 ans = 3.318 / Quartile 1 dans Fisheries  ; Zoology ; Quartile 3 dans Immunology

Clerissi C., De Lorgeril J., Petton B., Lucasson A., Escoubas J.M., Gueguen Y., Dégremont L., Mitta G. and Toulza E. (2020) Microbiota composition and evenness predict survival rate of oysters confronted to pacific oyster mortality syndrome. Frontiers in Microbiology 11: 311
DOI 10.3389/fmicb.2020.00311 / HAL / Facteur d’impact 2019=4.235 / 5 ans = 4.926 / Quartile 1 dans Microbiology

De Carvalho Augusto R., Merad N., Rognon A., Gourbal B., Bertrand C., Djabou N. and Duval D. (2020) Molluscicidal and parasiticidal activities of Eryngium triquetrum essential oil on Schistosoma mansoni and its intermediate snail host Biomphalaria glabrata, a double impact. Parasites & Vectors 13: 486
DOI 10.1186/s13071-020-04367-w /HAL / Facteur d’impact 2019=2.824 / 5 ans = 3.169 / Quartile 1 dans Parasitology ; Tropical Medicine

De Carvalho Augusto R., Minoda A. and Grunau C. (2020) A simple ATAC-seq protocol for population epigenetics [version 1; peer review: 1 approved with reservations]. Wellcome Open Research, 5 : 121. Wellcome Open Research 5: 121
DOI 10.12688/wellcomeopenres.15552.1 / HAL 

De Lorgeril J., Petton B., Lucasson A., Perez V., Stenger P.L., Dégremont L., Montagnani C., Escoubas J.M., Haffner P., Allienne J.F., Leroy M., Lagarde F., Vidal-Dupiol J., Gueguen Y. and Mitta G. (2020) Differential basal expression of immune genes confers Crassostrea gigas resistance to Pacific Oyster Mortality Syndrome. BMC Genomics 21: 63
DOI 10.21203/rs.2.16448/v2 / HAL / Facteur d’impact 2019=3.594 / 5 ans = 4.093 / Quartile 2 dans Biotechnologies & Applied Microbiology  ; Genetics & Heredity

Delmotte J., Chaparro C., Galinier R., De Lorgeril J., Petton B., Stenger P.L., Vidal-Dupiol J., Destoumieux-Garzon D., Gueguen Y., Montagnani C., Escoubas J.M. and Mitta G. (2020) Contribution of viral genomic diversity to oyster susceptibility in the Pacific oyster mortality syndrome. Frontiers in Microbiology 11: 1579
DOI 10.3389/fmicb.2020.01579 / HAL / Facteur d’impact 2019=4.235 / 5 ans = 4.926 / Quartile 1 dans Microbiology

Dupont S., Lokmer A., Corre E., Auguet J.-C., Petton. B., Toulza E., Montagnani C., Tanguy G., Pecqueur D., Salmeron C., Guillou L., Desnues C., La Scola B., Bou Khalil J., de Lorgeril J., Mitta G., Gueguen Y. and Escoubas J.-M. (2020) Oyster hemolymph is a complex and dynamic ecosystem hosting bacteria, protists and viruses. Animal Microbiome 2: 12
DOI 10.1186/s42523-020-00032-w / HAL 

Duval D., Pichon R., Lassalle D., Laffitte M., Gourbal B. and Galinier R. (2020) A new assessment of Thioester-containing proteins diversity of the freshwater snail Biomphalaria glabrata. Genes MDPI 11: 69
DOI 10.3390/genes11010069 / HAL / Facteur d’impact 2019=3.759 / 5 ans = 3.822 / Quartile 2 dans Genetics & Heredity

Grunau C., Le Luyer J., Laporte M. and Joly D. (2020) The epigenetics dilemma. Genes Special Issue Epigenetics and Adaptation 11: 23
DOI 10.3390/genes11010023 /HAL / Facteur d’impact 2019=3.759 / 5 ans = 3.822 / Quartile 2 dans Genetics & Heredity

Huot C., Clerissi C., Gourbal B., Galinier R., Duval D. and Toulza E. (2020) Schistosomiasis vector snails and their microbiota display a phylosymbiosis pattern. Frontiers in Microbiology 10: 3092
DOI 10.3389/fmicb.2019.03092 /HAL / Facteur d’impact 2019=4.235 / 5 ans = 4.926 / Quartile 1 dans Microbiology

Lafont M., Vergnes A., Vidal-Dupiol J., De Lorgeril J., Gueguen Y., Haffner P., Petton B., Chaparro C., Barrachina C., Destoumieux-Garzon D., Mitta G., Gourbal B. and Montagnani C. (2020) A sustained mechanism supports long-term immune priming in the pacific oyster Crassostrea gigas. mBIO 11: e02777-02719
DOI 10.1128/mBio.02777-19 / HAL / Facteur d’impact 2019=6.784 / 5 ans = 7.349 / Quartile 1 dans Microbiology

Lassalle D., Tétreau G., Pinaud S., Galinier R., Crickmore N., Gourbal B. and Duval D. (2020) Glabralysins, Potential New β-Pore-Forming Toxin Family Members from the Schistosomiasis Vector Snail Biomphalaria glabrata. Genes MDPI 11 : 65
DOI 10.3390/genes11010065 / HAL / Facteur d’impact 2019=3.759 / 5 ans = 3.822 / Quartile 2 dans Genetics & Heredity

Le Govic Y., Gourbal B. and Boissier J. (2020) Booming omics in Schistosoma. Trends in Parasitology online
DOI 10.1016/j.pt.2020.10.010 / Facteur d’impact 2019=6.918 / 5 ans = 7.352 / Quartile 1 dans Parasitology

Lima M.G., De Carvalho Augusto R., Pinheiro da Silva J. and Thiengo S.C. (2020) Physiology and immunity of the invasive giant African snail, Achatina (Lissachatina) fulica, intermediate host of Angiostrongylus cantonensis. Developmental and Comparative Immunology 105: 103579
DOI 10.1016/j.dci.2019.103579 /HAL / Facteur d’impact 2019=3.192 / 5 ans = 3.318 / Quartile 1 dans Fisheries ; Quartile 1 dans Zoology  ; Quartile 3 dans Immunology

Planques, A., P. Kerner, L. Ferry, C. Grunau, E. Gazave and M. Vervoort (2020) DNA methylation during development and regeneration of the annelid platynereis dumerilii. BIORXIV (381673 du 13 nov 2020)

Sow M.D., Le Gac A.L., Fichot R., Lanciano S., Delaunay A., Le Jan I., Lesage-Descauses M.C., Citerne S., Caius J., Brunaud V., Soubigou-Taconnat L., Cochard H., Segura V., Chaparro C., Grunau C., Daviaud C., Tost J., Brignolas F., Strauss S.H., Mirouze and Maury S. (2020) Hypomethylated poplars show higher tolerance to water deficit and highlight a dual role for DNA methylation in shoot meristem: regulation of stress response and genome integrity. BIORXIV (045328 du 20 avril 2020)

Tetreau, G., J. Dhinaut, R. Galinier, P. Audant-Lacour, S. N. Voisin, K. Arafah, M. Chogne, F. Hilliou, A. Bordes, C. Sabarly, P. Chan, M. L. Walet-Balieu, D. Vaudry, D. Duval, P. Bulet, C. Coustau, Y. Moret and B. Gourbal (2020) Deciphering the molecular mechanisms of mother-to-egg immune protection in the mealworm beetle Tenebrio molitor. Plos Pathogens 16(10): 30
DOI 10.1371/journal.ppat.1008935 /  HAL / Facteur d’impact 2019=6.218  / 5 ans=6.479 / Quartile 1 Microbiology ; Quartile 1 Parasitology  ; Quartile 1 virology

Vidal-Dupiol J., Chaparro C., Pratlong M., Pontarotti P., Grunau C. and Mitta G. (2020) Sequencing, de novo assembly and annotation of the genome of the scleractinian coral, Pocillopora acuta. BIORXIV (698688 du 19 avril 2020)

Padalino G., Celatka C., Rienhoff H.Y., Kalin J.H., Cole P.A., Lassalle D., Grunau C., Chalmers I.W., Brancale A. and Hoffmann K.F. (2020) Schistosoma mansoni lysine specific demethylase 1 (SmLSD1) is a druggable target involved in parasite survival, oviposition and stem cell proliferation. BIORXIV (301184 du 17 sept 2020)

2019

Alba, A., G. Tétreau, C. Chaparro, J. Sanchez, A. A. Vazquez and B. Gourbal (2019) Natural resistance to Fasciola hepatica (Trematoda) in Pseudosuccinea columella snails: A review from literature and insights from comparative “omic” analyses. Developmental and Comparative Immunology 101: 103463
DOI 10.1016/j.dci.2019.103463 / HAL /

Alba, A., A. A. Vazquez, J. Sanchez, M. Lounnas, J. P. Pointier, S. Hurtrez-Boussès and B. Gourbal (2019) Patterns of distribution, population genetic and ecological requirements of field-occurring resistant and susceptible Pseudosuccinea columella snails to Fasciola hepatica in Cuba. Scientific Reports 9: 14359.
DOI 10.1038/s41598-019-50894-7 / HAL /

Aliaga, B., I. Bulla, G. Mouahid, D. Duval and C. Grunau (2019) Universality of the DNA methylation codes in Eucaryotes. Scientific Reports 9: 173
DOI 10.1038/s41598-018-37407-8 / HAL /

Brener-Raffalli, K., J. Vidal-Dupiol, M. Adjeroud, O. Rey, P. Romans, F. Bonhomme, M. Pratlong, A. Haguenauer, R. Pillot, L. Feuillassier, M. Claereboudt, H. Magalon, P. Gélin, P. Pontarotti, D. Aurelle, G. Mitta and E. Toulza (2019) Gene expression plasticity and frontloading promote thermotolerance in Pocilloporid corals. BioRxiv (398602 en 2018) and  Peer reviewed and recommended by PCI Ecology (26 august 2019)

Brown, P., Relish Consortium [dont C. Grunau] and Zhou Y. (2019). Large expert-curated database for benchmarking document similarity detection in biomedical literature search. » DATABASE – The Journal of Biological Databases and Curation 2019: baz085.
DOI 10.1093/database/baz085 / HAL /

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