Equipe 2MAP : Mécanismes d’Adaptation et de Plasticité

Approches intégratives visant à caractériser les mécanismes moléculaires d’interaction des hôtes vis à vis de leurs pathogènes sous influence environnementale

Dans l’équipe 2MAP, nous caractérisons les processus cellulaires et moléculaires impliqués dans les interactions hôte / symbiote / pathogène pour comprendre l’adaptation des organismes hôtes. Nous étudions en particulier les mécanismes immunitaires de l’hôte et leur plasticité face aux contraintes biotiques et abiotiques. Afin d’atteindre ces objectifs, nous travaillons sur des systèmes expérimentaux animaux simplifiés en utilisant des génotypes sélectionnés aux phénotypes contrastés. Nous travaillons sur des modèles invertébrés d’intérêt économique et en santé humaine et animale, pour étudier des maladies d’étiologie complexe. Nous utilisons et intégrons des approches «omiques», comme la génomique, la transcriptomique, et l’épigénomique, et également des méthodes de biologie fonctionnelle, comme la transgénèse ou l’invalidation de gènes.

L’équipe 2MAP est organisée en 3 axes :

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Axe 1: Mécanismes moléculaires de la dynamique co-évolutiveAxe 2. Systèmes de défense de l’hôte: équilibre entre coût et fitnessAxe 3. Vers une vision unifiée de la mémoire immunitaire innée chez les invertébrés
Les pressions de sélection entre les hôtes et leurs parasites peuvent entraîner une évolution réciproque ou une adaptation de traits d’histoire de vie spécifiques de ces protagonistes. Cette coévolution entre hôtes et parasites devrait entraîner des variations de l'infectivité / virulence des parasites et de la défense / réponse immunitaire des hôtes. L'analyse des déterminants moléculaires impliqués dans ces interactions est toutefois peu étudiée. Ainsi, les modèles biologiques actuels dans ce conteste de dynamique coévolutive doivent être revus et nourris de connaissances nouvelles et plus détaillées sur les mécanismes moléculaires sous-jacents. En utilisant nos modèles invertébrés d'importance écologique et économique et des pédigrées générés en laboratoire, nous développons des approches «omiques» intégratives pour déchiffrer les bases moléculaires de la compatibilité hôte/parasite.La compréhension des interactions entre l’hôte, les pathogènes et l’environnement dans un contexte de maladies infectieuses est d’importance majeure pour contrôler et prédire les risques épidémiologiques. En focalisant sur le système de défense, nous voulons identifier des déterminants de la sensibilité et la résistance des hôtes (ie. déterminants transcriptomiques validés fonctionnellement) aux maladies infectieuses touchant nos modèles d’invertébrés. Du fait que développer une résistance représente un cout pour l’organisme, une attention particulière est portée sur les « trade-offs » de cette résistance sur d’autres traits d’intérêts (fécondité, grossissement, résistance à d’autres maladies infectieuses…). Ces travaux prennent également en compte des contraintes environnementales affectant nos modèles d’invertébré, comme par exemple les variations de température ou d’apports alimentaires.Tous les organismes vivants ont développé des systèmes de défense capables de reconnaître et de contrôler / contenir et / ou d’éliminer la plupart des agents pathogènes rencontrés au cours de leur vie. Au cours des deux dernières décennies, un nombre croissant d’études sur les procaryotes, les plantes et les invertébrés ont démontré que ces organismes étaient capables de mettre en œuvre une réponse immunitaire acquise (améliorée) qui peut être spécifique et durable, les protégeant ainsi contre les infections ultérieures (mémoire immunitaire innée, IIM). Nous étudions l’existence de l’IIM chez les invertébrés en utilisant des approches moléculaires et cellulaires intégratives et comparatives de pointe dans le but de réconcilier la phénoménologie avec les mécanismes et de revisiter la dichotomie artificielle entre l’immunité innée et l’immunité adaptative.


Responsables :
GOURBAL Benjamin, Maître de conférence Univ. Perpignan
BOULO Viviane, Chercheuse Ifremer

Personnel permanent :
GALINIER Richard, Ingénieur de recherches CNRS
GRUNAU Christoph, Professeur Univ. Perpignan
MITTA Guillaume, Professeur Univ. Perpignan
VIGNAL Emmanuel, Maître de conférences Univ. Montpellier

Personnel non permanent :
BOISMORAND Louis, Doctorant Univ. Perpignan
GIRAUD Carolane, Doctorante – Nouvelle Calédonie
LASSALLE Damien, Doctorant Univ. Perpignan
LUVIANO APARICIO Nelia, Doctorante Univ. Perpignan
PICHON Rémi, Doctorant Univ. Perpignan
POTEAUX Pierre, Doctorant Univ. Perpignan
SIMPHOR Elodie, Doctorante Univ. Perpignan

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Internationaux

WELLCOME TRUST : FUGI (2018-2022) Functional Genomics of Flatworms
Porteur de projet : Karl Hoffmann
Responsable scientifique IHPE : Christoph Grunau
Partenaires : Aberystwyth University UKWellcome Sanger Institute UK  /  University of Würzburg Allemagne  /  George Washington University USA  /  UT Southwestern Medical Center USA  /  University of Giessen Allemagne  /  Cambridge Stem Cell Institute UK

CNRS PRC : HEMOPUL (2020-2023) Etude de l’hématopoïèse des Gastéropodes pulmonés
Porteur de projet : Benjamin Gourbal
Responsable scientifique IHPE : Benjamin Gourbal
Partenaires : Université de St Pétersburg, Russie

FAPESP : EPICURE (2019-2020) Assessing the EPIgenetic changes in Schistosoma mansoni developmental trajectory after in-vitro treatment with serum from schistosomiasis se.f-CUREd macaques
Porteur de projet : Sergio Verjovski-Almeida
Responsable scientifique IHPE : Christoph Grunau
Partenaires : Butantan Institute Brésil

Nationaux

ANR : AEROSNAIL (2020-2024) Structure Fonction des Biomphalysines. Identification des partenaires et récepteurs des Biomphalysines
Porteur de projet : David Duval
Responsable scientifique IHPE : David Duval
Partenaires :  IPBS Toulouse  /  LIEC Nancy

ANR : DECICOMP (2019-2024) Deciphering the whole complexity of the Pacific oyster mortality syndrome for modeling epidemiological risk
Porteur de projet : Guillaume Mitta
Responsable scientifique IHPE : Guillaume Mitta
Partenaires : IHPE, Equipe MIA IHPE, Equipe TREV PFOM Plouzané  /  LGPMM La Tremblade  /  LBI2M Roscoff MIVEGEC Montpellier

ANR : ADMIRE (2018-2022) Adaptation of Meloidogyne to host REsistance
Porteur de projet : Pierre Abad
Responsable scientifique IHPE : Christoph Grunau
Partenaires : Institut Sophia Agrobiotech Nice

Institutionnels

Labex CEMEB-ERJ : METABIOMPH (2021-2021) Métabolisme des hémocytes de Biomphalaria glabrata en réponse à une infestation par Schistosoma mansoni
Porteur de projet : Rémi Pichon
Responsable scientifique IHPE : Benjamin Gourbal
Partenaires :  HSM Montpellier  C3M Nice  /  Plateforme Métabolomique Montpellier

IFREMER POLITIQUE DE CENTRE : COMISTYL (2019-2021)  COmmunauté Microbienne et Immunité de STYLirostris
Porteur de projet : Nolwenn Callac
Responsable scientifique IHPE : Viviane Boulo
Partenaires : LEAD-NC Nouvelle-Calédonie  / Unité RMPF Polynésie Française

IFREMER : DEMOMYT (2020-2022) Décryptage de la maladie responsable des mortalités massives de moules
Porteur de projet : Guillaume Mitta
Responsable scientifique IHPE : Guillaume Mitta
Partenaires :  IHPE, Equipe MIALGPMM La Tremblade

Régionaux

Région Occitanie, Bourse de thèse : BIOSELECT (2020-2023) Caractérisation des facteurs de résistance dans l’interaction Biomphalaria / Schistosoma
Porteur de projet : David Duval
Responsable scientifique IHPE : David Duval
Partenaires : Oregon State University USA

Région Occitanie, Bourse de thèse : EPIPARA (2018-2021) Genie EPIgénétique: controle PARAsitaire avec des “armes” non-conventionnelles
Porteur de projet : Christoph Grunau
Responsable scientifique IHPE : Christoph Grunau
Partenaires : IHPE, Equipe TREV


mise à jour en cours

DISCLAIMER – Our group provides this data in good faith, but makes no warranty, express or implied, or assumes any legal liability or responsibility for any purpose that the data is used for.


MethDB:  the database for DNA methylation and environmental epigenetic effects.


PrimerDB:  the local oligonucleotide database (access restriction applies).


AntibodyDB:  the local antibody database (access restriction applies).


Local Galaxy Instance provides a graphical interface for bioinformatics analysis (access restriction applies)


SchistoGbrowse v2.54 genome browser for assembly version 5.2 (access restriction applies)


SnakeCharmer for selection of restriction enzymes for COmbined Bisulfite Restriiction Assay (COBRA)


MethTools analysis of bisulfite DNA methylation sequencing


EN COURS

Louis BOISMORAND (2023 Dir. Guillaume Mitta & Jérémie Vidal-Dupiol)
Comment la température et la nutrition contrôlent elles la susceptibilité des huîtres au syndrome de mortalité des huîtres du pacifique ?
Pierre POTEAUX (2023  Dir. David Duval & Benjamin Gourbal)
Caractérisation des facteurs immunitaires (Biomphalysines) dans la résistance au parasite Schistosoma chez Biomphalaria
Elodie SIMPHOR (2023 Dir. David Duval & Benjamin Gourbal)
Caractérisation des facteurs immunitaires dans la résistance au parasite Schistosoma chez Biomphalaria
Carolane GIRAUD (2022 Dir. Viviane Boulo)
Méta-analyses des communautés microbiennes de l’eau au lagon à l’élevage larvaire en lien avec les facteurs environnementaux
Rémi PICHON (2022 Dir. Benjamin Gourbal & Richard Galinier)
Aspects fonctionnel et évolutif de l’immunité mémoire chez l’escargot vecteur de la bilharziose intestinale Biomphalaria glabrata
Nelia LUVIANO (29 janvier 2021 Dir. Christoph Grunau & Céline Cosseau)
La méthylation de l’ADN chez Biomphalaria glabrata, rôle et impact sur la transmission de la bilharziose.
Damien LASSALLE (16 Décembre 2020 Dir. Benjamin Gourbal & David Duval)
Mécanismes d’action des Biomphalysines, de nouvelles cibles thérapeutiques contre la bilharziose.

SOUTENUES
Manon FALLET (12/12/2019 Dir. Christoph Grunau & Céline Cosseau)
Etude de la réponse environnementale et transgénérationelle chez l’huître creuse Crassostrea gigas. Focus sur les mécanismes épigénétiques.
Camille HUOT (25/10/2019 Dir. David Duval & Eve Toulza)
Caractérisation et rôle, dans l’interaction tripartite, du microbiote d’hôtes intermédiaires Planorbidae des parasites trématodes Schistosoma spp., agents responsables de la bilharziose.

Annia ALBA (12/12/2018 Dir. Benjamin Gourbal & Antonio Vasquez) le pdf
Comparative biology of naturally resistant / susceptible Pseudosuccinea columella (Mollusca: Gastropoda) to Fasciola hepatica (Trematoda) infection in Cuba: ecological, molecular and phenotypical aspects.
Aude LUCASSON (22/11/2018 Dir. Julien De Lorgeril & Guillaume Mitta) le pdf
Caractérisation et diversité des mécanismes du syndrome de mortalité affectant les juvéniles de Crassostrea gigas.
Benoît ALIAGA (24/05/2018 Dir. Christoph Grunau & David Duval) le pdf
Comparaison des épigénomes des espèces non modèles.

Maxime LAFONT (22/11/2017 Dir. Benjamin Gourbal & Caroline Montagnani) le pdf
Mécanismes et spécificité du priming immunitaire antiviral chez un Lophotrochozoaire, l’huître creuse Crassostrea gigas.
Kelly BRENER-RAFFALLI (9/11/2017 Dir. Guillaume Mitta & Eve Toulza) le pdf
Dynamique de l’holobionte corallien et plasticité transcriptomique : variabilité interindividuelle, interpopulationnelle et interspécifique.
Silvain PINAUD (19/10/2017 Dir. Guillaume Mitta & David Duval) le pdf
Aspects fonctionnels et évolutif de l’immunité mémoire chez les invertébrés : l’escargot vecteur de la Bilharziose intestinale Biomphalaria glabrata comme nouvel organisme modèle ?
Anaïs PORTET (17/10/2017 Dir. Benjamin Gourbal & Richard Galinier) le pdf
Décryptage du Polymorphisme de Compatibilité dans l’interaction entre Biomphalaria glabrata et Schistosoma mansoni : une approche intégrative.

David ROQUIS (08/12/2015 Dir. Christoph Grunau & Céline Cosseau) le pdf
Contribution de l’épigénétique dans les  Dauermodifikations et l’évolution adaptative chez le  parasite humain Schistosoma mansoni et le corail  tropical Pocillopora damicornis.

ARTICLES SCIENTIFIQUESEn cliquant sur l’image vous pouvez la déplacer. Tout en bas vous retrouverez la liste des laboratoires collaborateurs.

Alba A., Duval D., Sanchez J., Pérez A.B., Pinaud S., Galinier R., Vazquez A.A. and Gourbal B. (2020) The immunobiological interplay between Pseudosuccinea columella resistant/susceptible snails with Fasciola hepatica: hemocytes in the spotlight. Developmental and Comparative Immunology 102: 103485
DOI 10.1016/j.dci.2019.103485 / HAL / Facteur d’impact 2019=3.192 / 5 ans = 3.318 / Quartile 1 dans Fisheries  ; Zoology ; Quartile 3 dans Immunology

Clerissi C., De Lorgeril J., Petton B., Lucasson A., Escoubas J.M., Gueguen Y., Dégremont L., Mitta G. and Toulza E. (2020) Microbiota composition and evenness predict survival rate of oysters confronted to pacific oyster mortality syndrome. Frontiers in Microbiology 11: 311
DOI 10.3389/fmicb.2020.00311 / HAL / Facteur d’impact 2019=4.235 / 5 ans = 4.926 / Quartile 1 dans Microbiology

De Carvalho Augusto R., Merad N., Rognon A., Gourbal B., Bertrand C., Djabou N. and Duval D. (2020) Molluscicidal and parasiticidal activities of Eryngium triquetrum essential oil on Schistosoma mansoni and its intermediate snail host Biomphalaria glabrata, a double impact. Parasites & Vectors 13: 486
DOI 10.1186/s13071-020-04367-w /HAL / Facteur d’impact 2019=2.824 / 5 ans = 3.169 / Quartile 1 dans Parasitology ; Tropical Medicine

De Carvalho Augusto R., Minoda A. and Grunau C. (2020) A simple ATAC-seq protocol for population epigenetics [version 1; peer review: 1 approved with reservations]. Wellcome Open Research, 5 : 121. Wellcome Open Research 5: 121
DOI 10.12688/wellcomeopenres.15552.1 / HAL 

De Lorgeril J., Petton B., Lucasson A., Perez V., Stenger P.L., Dégremont L., Montagnani C., Escoubas J.M., Haffner P., Allienne J.F., Leroy M., Lagarde F., Vidal-Dupiol J., Gueguen Y. and Mitta G. (2020) Differential basal expression of immune genes confers Crassostrea gigas resistance to Pacific Oyster Mortality Syndrome. BMC Genomics 21: 63
DOI 10.21203/rs.2.16448/v2 / HAL / Facteur d’impact 2019=3.594 / 5 ans = 4.093 / Quartile 2 dans Biotechnologies & Applied Microbiology  ; Genetics & Heredity

Delmotte J., Chaparro C., Galinier R., De Lorgeril J., Petton B., Stenger P.L., Vidal-Dupiol J., Destoumieux-Garzon D., Gueguen Y., Montagnani C., Escoubas J.M. and Mitta G. (2020) Contribution of viral genomic diversity to oyster susceptibility in the Pacific oyster mortality syndrome. Frontiers in Microbiology 11: 1579
DOI 10.3389/fmicb.2020.01579 / HAL / Facteur d’impact 2019=4.235 / 5 ans = 4.926 / Quartile 1 dans Microbiology

Dupont S., Lokmer A., Corre E., Auguet J.-C., Petton. B., Toulza E., Montagnani C., Tanguy G., Pecqueur D., Salmeron C., Guillou L., Desnues C., La Scola B., Bou Khalil J., de Lorgeril J., Mitta G., Gueguen Y. and Escoubas J.-M. (2020) Oyster hemolymph is a complex and dynamic ecosystem hosting bacteria, protists and viruses. Animal Microbiome 2: 12
DOI 10.1186/s42523-020-00032-w / HAL 

Duval D., Pichon R., Lassalle D., Laffitte M., Gourbal B. and Galinier R. (2020) A new assessment of Thioester-containing proteins diversity of the freshwater snail Biomphalaria glabrata. Genes MDPI 11: 69
DOI 10.3390/genes11010069 / HAL / Facteur d’impact 2019=3.759 / 5 ans = 3.822 / Quartile 2 dans Genetics & Heredity

Grunau C., Le Luyer J., Laporte M. and Joly D. (2020) The epigenetics dilemma. Genes Special Issue Epigenetics and Adaptation 11: 23
DOI 10.3390/genes11010023 /HAL / Facteur d’impact 2019=3.759 / 5 ans = 3.822 / Quartile 2 dans Genetics & Heredity

Huot C., Clerissi C., Gourbal B., Galinier R., Duval D. and Toulza E. (2020) Schistosomiasis vector snails and their microbiota display a phylosymbiosis pattern. Frontiers in Microbiology 10: 3092
DOI 10.3389/fmicb.2019.03092 /HAL / Facteur d’impact 2019=4.235 / 5 ans = 4.926 / Quartile 1 dans Microbiology

Lafont M., Vergnes A., Vidal-Dupiol J., De Lorgeril J., Gueguen Y., Haffner P., Petton B., Chaparro C., Barrachina C., Destoumieux-Garzon D., Mitta G., Gourbal B. and Montagnani C. (2020) A sustained mechanism supports long-term immune priming in the pacific oyster Crassostrea gigas. mBIO 11: e02777-02719
DOI 10.1128/mBio.02777-19 / HAL / Facteur d’impact 2019=6.784 / 5 ans = 7.349 / Quartile 1 dans Microbiology

Lassalle D., Tétreau G., Pinaud S., Galinier R., Crickmore N., Gourbal B. and Duval D. (2020) Glabralysins, Potential New β-Pore-Forming Toxin Family Members from the Schistosomiasis Vector Snail Biomphalaria glabrata. Genes MDPI 11 : 65
DOI 10.3390/genes11010065 / HAL / Facteur d’impact 2019=3.759 / 5 ans = 3.822 / Quartile 2 dans Genetics & Heredity

Le Govic Y., Gourbal B. and Boissier J. (2020) Booming omics in Schistosoma. Trends in Parasitology online
DOI 10.1016/j.pt.2020.10.010 / Facteur d’impact 2019=6.918 / 5 ans = 7.352 / Quartile 1 dans Parasitology

Lima M.G., De Carvalho Augusto R., Pinheiro da Silva J. and Thiengo S.C. (2020) Physiology and immunity of the invasive giant African snail, Achatina (Lissachatina) fulica, intermediate host of Angiostrongylus cantonensis. Developmental and Comparative Immunology 105: 103579
DOI 10.1016/j.dci.2019.103579 /HAL / Facteur d’impact 2019=3.192 / 5 ans = 3.318 / Quartile 1 dans Fisheries ; Quartile 1 dans Zoology  ; Quartile 3 dans Immunology

Planques, A., P. Kerner, L. Ferry, C. Grunau, E. Gazave and M. Vervoort (2020) DNA methylation during development and regeneration of the annelid platynereis dumerilii. BIORXIV (381673 du 13 nov 2020)

Sow M.D., Le Gac A.L., Fichot R., Lanciano S., Delaunay A., Le Jan I., Lesage-Descauses M.C., Citerne S., Caius J., Brunaud V., Soubigou-Taconnat L., Cochard H., Segura V., Chaparro C., Grunau C., Daviaud C., Tost J., Brignolas F., Strauss S.H., Mirouze and Maury S. (2020) Hypomethylated poplars show higher tolerance to water deficit and highlight a dual role for DNA methylation in shoot meristem: regulation of stress response and genome integrity. BIORXIV (045328 du 20 avril 2020)

Tetreau, G., J. Dhinaut, R. Galinier, P. Audant-Lacour, S. N. Voisin, K. Arafah, M. Chogne, F. Hilliou, A. Bordes, C. Sabarly, P. Chan, M. L. Walet-Balieu, D. Vaudry, D. Duval, P. Bulet, C. Coustau, Y. Moret and B. Gourbal (2020) Deciphering the molecular mechanisms of mother-to-egg immune protection in the mealworm beetle Tenebrio molitor. Plos Pathogens 16(10): 30
DOI 10.1371/journal.ppat.1008935 /  HAL / Facteur d’impact 2019=6.218  / 5 ans=6.479 / Quartile 1 Microbiology ; Quartile 1 Parasitology  ; Quartile 1 virology

Vidal-Dupiol J., Chaparro C., Pratlong M., Pontarotti P., Grunau C. and Mitta G. (2020) Sequencing, de novo assembly and annotation of the genome of the scleractinian coral, Pocillopora acuta. BIORXIV (698688 du 19 avril 2020)

Padalino G., Celatka C., Rienhoff H.Y., Kalin J.H., Cole P.A., Lassalle D., Grunau C., Chalmers I.W., Brancale A. and Hoffmann K.F. (2020) Schistosoma mansoni lysine specific demethylase 1 (SmLSD1) is a druggable target involved in parasite survival, oviposition and stem cell proliferation. BIORXIV (301184 du 17 sept 2020)

Alba, A., G. Tétreau, C. Chaparro, J. Sanchez, A. A. Vazquez and B. Gourbal (2019) Natural resistance to Fasciola hepatica (Trematoda) in Pseudosuccinea columella snails: A review from literature and insights from comparative “omic” analyses. Developmental and Comparative Immunology 101: 103463
DOI 10.1016/j.dci.2019.103463 / HAL /

Alba, A., A. A. Vazquez, J. Sanchez, M. Lounnas, J. P. Pointier, S. Hurtrez-Boussès and B. Gourbal (2019) Patterns of distribution, population genetic and ecological requirements of field-occurring resistant and susceptible Pseudosuccinea columella snails to Fasciola hepatica in Cuba. Scientific Reports 9: 14359.
DOI 10.1038/s41598-019-50894-7 / HAL /

Aliaga, B., I. Bulla, G. Mouahid, D. Duval and C. Grunau (2019) Universality of the DNA methylation codes in Eucaryotes. Scientific Reports 9: 173
DOI 10.1038/s41598-018-37407-8 / HAL /

Brener-Raffalli, K., J. Vidal-Dupiol, M. Adjeroud, O. Rey, P. Romans, F. Bonhomme, M. Pratlong, A. Haguenauer, R. Pillot, L. Feuillassier, M. Claereboudt, H. Magalon, P. Gélin, P. Pontarotti, D. Aurelle, G. Mitta and E. Toulza (2019) Gene expression plasticity and frontloading promote thermotolerance in Pocilloporid corals. BioRxiv (398602 en 2018) and  Peer reviewed and recommended by PCI Ecology (26 august 2019)

Brown, P., Relish Consortium [dont C. Grunau] and Zhou Y. (2019). Large expert-curated database for benchmarking document similarity detection in biomedical literature search. » DATABASE – The Journal of Biological Databases and Curation 2019: baz085.
DOI 10.1093/database/baz085 / HAL /

de Carvalho Augusto, R., D. Duval and C. Grunau (2019) Effects of the environment on developmental plasticity and infection success of Schistosoma parasites – an epigenetic perspective. Frontiers in Microbiology (Section Microbial Immunology) 10: 1475.
DOI 10.3389/fmicb.2019.01475 / HAL /

De Carvalho Augusto, R., A. Minoda and C. Grunau (2019) A simple ATAC-seq protocol for population epigenetics. Protocols.io
DOI 10.17504/protocols.io.bae6ibheHAL

Lima, M. G., L. C. Montresor, J. Pontes, R. C. Augusto, J. Pinheiro da Silva and S. C. Thiengo (2019) Compatibility polymorphism based on long-term host-parasite relationships: cross talking between Biomphalaria glabrata and the trematode Schistosoma mansoni from endemic areas in Brazil. Frontiers in Immunology 30: 328.
DOI 10.3389/fimmu.2019.003282018 / HAL /

Petton, B., J. De Lorgeril, G. Mitta, G. Daigle, F. Pernet and M. Alunno-Bruscia (2019) Fine-scale temporal dynamics of herpes virus and vibrios in seawater during a polymicrobial infection in the Pacific oyster Crassostrea gigas. Diseases of Aquatic Organisms 135(2): 97-106
DOI 0.3354/dao03384 / HAL /

Picard, M. A. L., B. Vicoso, D. Roquis, I. Bulla, R. De Carvalho Augusto, N. Arancibia, C. Grunau, J. Boissier and C. Cosseau (2019) Dosage compensation throughout the Schistosoma mansoni lifecycle: specific chromatin landscape of the Z chromosome. Genome Biology and Evolution 11(7): 1909-1922
DOI 10.1093/gbe/evz133 / HAL /

Pinaud, S., A. Portet, J. F. Allienne, L. Belmudes, C. Saint-Béat, N. Arancibia, R. Galinier, L. Du Pasquier, D. Duval and B. Gourbal (2019) Molecular characterisation of immunological memory following homologous or heterologous challenges in the Schistosomiasis vector snail, Biomphalaria glabrata. Developmental and Comparative Immunology 92: 238-252
DOI 10.1016/j.dci.2018.12.001 / HAL /

Portet, A., S. Pinaud, C. Chaparro, R. Galinier, N. M. Dheilly, J. Portela, G. Charrière, J. F. Allienne, D. Duval and B. Gourbal (2019) Sympatric versus allopatric evolutionary contexts shape differential immune response in Biomphalaria / Schistosoma interaction. Biorxiv (378034) +  Plos Pathogens 15(3): e1007647
DOI 10.1371/journal.ppat.1007647 / HAL /

Roquis, D., A. Picart-Picolo, K. Brener Raffalli, P. Romans, P. Masanet, C. Cosseau, G. Mitta, C. Grunau and J. Vidal-Dupiol (2019) The tropical coral Pocillopora acuta has a mosaic DNA methylome, an unusual chromatin structure and shows histone H3 clipping. BioRxiv (722322v722321)

Rubio, T., D. Oyanedel-Trigo, Y. Labreuche, E. Toulza, X. Luo, M. Bruto, C. Chaparro, M. Torres, J. De Lorgeril, P. Haffner, J. Vidal-Dupiol, A. Lagorce, B. Petton, G. Mitta, A. Jacq, F. Le Roux, G. Charrière and D. Destoumieux-Garzón (2019) Species-specific mechanisms of cytotoxicity towards immune cells determine the successful outcome of Vibrio infections. Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA 116: 14238-14247
DOI 10.1073/pnas.1905747116 /HAL /

Tetreau, G., J. Dhinaut, B. Gourbal and Y. Moret (2019) Trans-generational immune priming in invertebrates: current knowledge and future prospects. Frontiers in Immunology 10(1938).
DOI 10.3389/fimmu.2019.01938 / HAL /

OUVRAGES

de Carvalho Augusto R., Cosseau C. and Grunau C. (2020) Histone Methylome of the Human Parasite Schistosoma Mansoni. IN Barciszewski J. and Jurga S. The DNA, RNA, and Histone Methylomes. Springer: 607-624 (ISBN 978-3030147914)

De Carvalho Augusto R., Roquis D., Picard M.A.L., Chaparro C., Cosseau C. and Grunau C. (2020) Measuring histone modifications in the human parasite Schistosoma mansoni. IN Timson D.  Schistosoma mansoni. Methods and Protocols, Springer: 93-107 (ISBN 978-1-0716-0634-6)

Moret, Y., C. Coustau, C. Braquart-Varnier and B. Gourbal (2019) Immune Priming and Trans-Generational Protection From Parasites. IN J. Choe Encyclopedia of animal behaviour 2nd edition. Elsevier Academic Press: 764-774 (ISBN 9780128096338)