 | IHPE UMR 5244 |
GRADE :Doctorant
ECOLE DOCTORALE : GAIA
ENCADRANTS : Jean-Michel ESCOUBAS
EQUIPE : TREV
RESEAUX SOCIAUX SCIENTIFIQUES:
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SUJET DE THESE :
Caractérisation de la diversité et de la dynamique du virome de Crassostrea gigas et analyse de son interaction avec la réponse antivirale de l’huître.
MOTS CLES :
Interactions biotiques ; Bio-informatique ; Holobionte ; Huître ; communauté virale ; communauté antivirale
PROJET DE THESE :
L’huître du Pacifique Crassostrea gigas subit depuis 2008 des mortalités récurrentes massives menaçant la filière ostréicole Française. Ces mortalités d’étiologie complexe ont été notamment associées à des infections bactériennes (du genre Vibrio) et virales (de type herpès, OsHV-1 µVar). Les conséquences économiques et environnementales majeures de ce phénomène pour la filière ostréicole ont motivé le développement d’axes de recherche au sein de notre laboratoire afin de d’identifier les facteurs clés impliqués dans le déclanchement de la maladie. Ces études intègrent notamment le rôle du fonds génétique des huîtres et de l’environnement dans la structuration des populations microbiennes qu’elles hébergent (projets : ANR Decipher, Hemo-microbiote, Amigo). Ces travaux font apparaître le rôle prépondérant des virus de type OsHV-1 µVar dans le déclenchement de la maladie mais des approches de métagénomique ont également mis en évidence la présence d’autres virus potentiellement pathogènes de l’huître (e.g. Picornaviridae) ou du microbiote qu’elle héberge (e.g. bacteriophages). Ces premiers résultats présagent de l’existence d’une communauté virale complexe associée aux huîtres. Or les virus sont de puissants modulateurs des populations microbiennes via leur pathogénicité mais aussi au travers de leur capacité à transférer du matériel génétique et à reprogrammer le métabolisme de leurs hôtes. Ces travaux font apparaitre la nécessité (i) de mieux caractériser la diversité et la dynamique des communautés virales associées aux huîtres et (ii) d’approfondir l’étude des mécanismes d’interaction entre l’immunité antivirale de l’hôte et son microbiote.
CURSUS :
2017 Master IMVI Immunologie Approfondie, option Advanced Immunology (Paris X, XI et XII)
2016 Maîtrise d’immunologie, Master Immunologie/Microbiologie/Virologie/Infectiologie (IMVI) : option Immunologie (Paris VII)
2015 Licence Biochimie Biologie BioInformatique, option chimie (Paris XII)
2014 DUT ABB (Toulon)
2012 Classe préparatoire aux grandes écoles TB (Lyon)
2011 Baccalauréat STL Biochimie Génie Biologique (Hyères)
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