IHPE – équipe MIMM (Mécanismes d’Interaction et d’adaptation en Milieu Marin)

EQUIPE MIMM
Mécanismes d’Interaction et d’Adaptation en Milieu Marin
Responsable : Delphine DESTOUMIEUX-GARZÓN

 rond-GB
Les invertébrés marins sont des espèces particulièrement sensibles aux stress environnementaux. Dans le contexte du changement global, les pressions environnementales s’accentuent, accroissant les phénomènes de mortalités aux  origines multifactorielles. Celles-ci sont particulièrement importantes pour les espèces côtières, lagunaires et lagonaires qui sont exposées à des microorganismes apportés par le bassin versant, aux pathogènes potentiels présents dans le milieu, ou encore à des efflorescences algales toxiques. De plus, dans ces écosystèmes de faible inertie, ces espèces sont confrontées à des changements rapides de température et de salinité et exposées à des xénobiotiques d’origine anthropique. La diversité de ces pressions biotiques et abiotiques et la méconnaissance de leur impact et de leurs synergies sur la physiologie et la fitness des invertébrés marins font qu’il est encore difficile de prédire les crises majeures que subissent ou subiront ces espèces. Dans ce contexte, notre objectif est de développer des approches intégratives visant à élucider les causes de ces crises chez une espèce d’intérêt aquacole, l’huître creuse Crassostrea gigas, et une espèce d’intérêt écologique, le corail Pocillopora damicornis.
Le projet de l’équipe vise d’une part à décrire les mécanismes qui gouvernent les interactions hôte-pathogène-environnement mises en jeu dans ces systèmes, notamment lors d’épisodes infectieux, et d’autre part à caractériser les réponses physiologiques et adaptatives des invertébrés marins et de leurs pathogènes face aux pressions environnementales. Nous nous intéresserons pour ceci non seulement aux mécanismes d’interaction mais également à leur diversité et à leur dynamique sous influence environnementale.
Offre de post-doctorat pour 2016 (clôt) :
« Hémo-microbiote de l’huître: diversité microbienne et dynamique au cours de pathogenèse expérimentale chez Crassostrea gigas» (Descriptif).

 

Une partie de l’équipe Mimm en octobre 2017

 PERSONNEL PERMANENT :
DESTOUMIEUX-GARZÓN Delphine (Ph.D, HDR), DR2 CNRS (90%)
BACHÈRE Evelyne (Ph.D, HDR), C3 Ifremer (100%)
CHARRIERE Guillaume (Ph.D), MCU UM (100%)
DE LORGERIL Julien (Ph.D), C1 Ifremer (100%)
ESCOUBAS Jean-Michel (Ph.D, HDR), CR1 CNRS (100%)
GUEGUEN Yannick (Ph.D, HDR), C3 Ifremer (100%)
HAFFNER Philippe, T Ifremer (100%)
LAGORCE Arnaud (Ph.D), MCU UPVD (100%)
LEROY Marc, TCN CNRS (100%)
MITTA Guillaume (Ph.D, HDR), PR1 UPVD (100%)
MONTAGNANI Caroline (Ph.D, HDR), C2a Ifremer (90%)
NOËL Thierry, C2A Ifremer (10%)
ROLLAND Jean-Luc (Ph.D), C1 Ifremer (100%)
VERGNES Agnès, T Ifremer (100%)
VIDAL-DUPIOL Jérémie, C1 Ifremer (100%)
PERSONNEL NON PERMANENT :
CLERISSI Camille, Post-Doctorant ifremer (50% MIMM, 50% ECOEVI)
DELMOTTE Jean, Doctorant, Allocataire UM
LUCASSON Aude, Doctorante, Allocataire UM/Ifremer
NADIR-MARASCO Sofia, étudiante en management (BTS en Alternance)
OYANEDEL Daniel, Doctorant, Allocataire Etranger (Chili)
PERRET Angélique, étudiante en biologie (Licence Pro en Alternance)
ROBINO Etienne, Doctorant, Allocataire UM
STENGER Pierre-Louis, Doctorant, Allocataire Université de Polynésie Française
TEANINIURAITEMOANA Vaihiti, Post-doctorante Ifremer Tahiti
ANCIEN PERSONNEL :
ABI KHALIL Celina
(Doctorante 2013-2016) Clinical & regulatory affairs chez BIOM’UP
BRENER RAFFALLI Kelly
(Doctorante 2013-2017) thèse soutenue le 9/11/2017
DA ROSA Rafael
(doctorant 2008-2011) Professeur, Laboratoire d’Immunologie Appliquée à l’Aquaculture, Université Fédérale de Santa Catarina, Florianópolis, SC, Brésil après un post-doctorat dans le laboratoire du Professeur Sirley Daffre à San Paulo, Brésil
–  DUPERTHY Marylise
(doctorante 2007-2010) Professeure adjointe au Département de microbiologie, infectiologie et immunologie de l’Université de Montréal, Canada après un post-doctorat au Department of Molecular Biology, The Laboratory for Molecular Infection Medicine Sweden (MIMS), Umeå University, Umeå, Suède
DUPONT Samuel
(Post-doctorant Ifremer 2014-2016) Gérant d’Entreprise.  Co-fondateur de la société Bioceanor, Cagnes-sur-mer, France
GONZALEZ Marcelo
(doctorant 2002-2005) Chercheur à l’INACH « Instituto Antartico Chileno »  – Laboratorio de Biorrecursos Antárticos – Punta Arenas Chili
GREEN Tim
(post-doctorant 2012-2013) Vancouver Island University (tenure track position)
LAFONT Maxime
(Doctorant 2014-2017) thèse soutenue le 22/11/2017
LOPEZ-JOVEN Carmen
(post-doctorante 2013-2015) Postdoctorat, Universidad Austral de Chile, Valdivia, Chili   @
MELLO Danielle F.
(Doctorante, bourse d’échange 2013) Post-doctoral associate, Meyer Lab, Duke University, NC, USA @
POIRIER Aurore
(Doctorante 2012-2015) Postdoctorat, Institute for Liver & Digestive Health, University College, London, Angleterre @
RONDON Rodolfo
(Doctorant 2013-2015) Post-doctorant, Laboratory of Biotechnology and Aquatic Genomics, Department of Oceanography, Interdisciplinary Center for Aquaculture Research (INCAR), University of Concepción, Concepción, Chili
RUBIO Tristan
(Doctorant 2014-2017) thèse soutenue le 23/11/2017
SCHMITT Paulina
(doctorante 2007-2010) Chercheur au Laboratoire de « Genética e Inmunología Molecular », Pontificia Universidad Católica de Valparaíso », Valparaíso, Chili   @ après un postdoctorat dans le laboratoire du Professeur Andrew Ouelette à l’University of South California, USA.
VANHOVE Audrey
(doctorante 2011-2014) Post-doctorat, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (Unité du Professeur Mélanie Blokesch), Suisse après un postdoctorat au Boston Children’s Hospital, Harvard Medical School (Unité du Professeur Paula Watnick), USA
VIDAL-DUPIOL Jérémie
(doctorant 2007-2011) Chercheur Ifremer, IHPE
ZENAGUI Reda
(doctorant 2008-2012) Ingénieur, Département de génétique moléculaire, Centre Hospitalier Universitaire de Montpellier, France
COLLABORATIONS NATIONALES :
– Frédérique LE ROUX, Ifremer, PFOM, Station Biologique de Roscoff
– Agnès TRAVERS, Ifremer, La Tremblade
– Bruno PETTON & Pierre BOUDRY, Ifremer, PFOM, Brest
– Annick JACQ, Université d’Orsay
– Claudine MEDIGUE, Génoscope, Ivry
– Farida AKCHA, Ifremer, Laboratoire Ecotoxicologie, Nantes
– David PIQUEMAL, ACOBIOM, Montpellier
– Alain GIVAUDAN & Sophie GAUDRIAULT, INRA, Montpellier
– Hervé COTTET, Institut Max Mousseron, Montpellier
COLLABORATIONS INTERNATIONALES :
– Sun NYUNT WAI & Marylise DUPERTHUY, The laboratory for molecular infection and medicine, University of Umea, Suède
– Mélanie BLOKESCH & Charles VAN DER HENST, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), Suisse
– Hans-Georg SAHL, Université de Bonn, Allemagne
– Rafael DA ROSA, Université Fédérale de Santa Catarina, Florianopolis, Brésil
– Marcelo GONZALEZ, Institut Antarctique Chilien (INACH), Chili
– Timothy GREEN, Macquarie University, Australie
– Paulina SCHMITT, Pontificia Universidad Católica de Valparaiso, Chili
–  VIBRIOGEN (2011-2016) – ANR –
Les vibrios pathogènes d’invertébrés marins: un nouveau regard sur la virulence et les réservoirs de gènes permettant l’adaptation à la niche écologique
–  DECIPHER (2014-2019) – ANR –
Déchiffrage des maladies multifactorielles : cas des mortalités de l’huître
–  ADACNI (2012-2016) – ANR –
Processus adaptatifs chez les cnidaires / Etude intégrative de la réponse au stress thermique et au changement climatique des gênes aux populations
GIMEPEC (2012-2015) – ANR –
Génotoxicité, immunotoxicité et reprotoxicité des pesticides chez Crassostrea gigas
InterVibrio (2014-2015) – Ec2co/INSU + Crédits d’incitation Ifremer
Rôle du plancton dans la transmission des vibrios pathogènes aux huîtres
PROVIGAS (2014-2017) – Chercheur d’avenir Région Languedoc Roussillon –
PROtection antiVIrale de l’huître Crassostrea giGAS

CONTRATS TERMINES

APOTOX (2013-2014) – Ec2co/INSU –
Etude des effets apoptotiques induits par les neurotoxines du dinoflagellé Alexandrium catenella chez l’huître Crassostrea gigas : conséquences sur la susceptibilité des huîtres aux pathogènes
BigDef (2013-2014) –
Vaincre la Mucoviscidose – Activité des défensines et big défensines d’invertébrés marins contre les pathogènes majeurs impliqués dans la mucoviscidose
AESTU+ (2014) – DPMA –
Mortalités d’huîtres creuses adultes (Crassostrea gigas) et infection à Vibrio aestuarianus – suite
SIGNAGENE2 (2014) – Région Languedoc Roussillon –
Utilisation de biomarqueurs génétiques en soutien à la sélection de souches d’huîtres présentant de meilleures capacités de survie
GENEPIH (2014) – eC2CO/INSU –
Modifications génétiques et épigénétiques d’une exposition au diuron chez l’huître creuse
Pathogas (2013-2014) – Crédit incitation Ifremer –
Peptides antimicrobiens, microbiome et homésotasie chez l’huitre C. gigas