 | IHPE UMR 5244 Université de Montpellier Place Eugène Bataillon CC 80 F-34095 Montpellier Cedex 5 Tel +33(0)4-67-14-46-06 Fax +33(0)4-67-14-46-22 email: yannick.labreuche@ifremer.fr |
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GRADE : chercheur IFREMER C2A
EQUIPE : 2MAP
RESEAUX SOCIAUX SCIENTIFIQUES :
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DOMAINE D’EXPERTISE-RECHERCHE :
Mon activité de recherche a d’abord concerné les pathologies bactériennes chez deux invertébrés marins d’intérêt aquacole (les crevettes pénéides et l’huître creuse), en m’appuyant sur les vibrios (bactéries marines ubiquistes des environnements marins) comme modèles d’étude. Mon intérêt scientifique a porté sur la compréhension des mécanismes moléculaires de virulence des vibrios pathogènes de ces invertébrés et l’étude des interactions hôte-pathogène, en m’attachant à comprendre leurs effets sur la réponse immunitaire de l’hôte. Après avoir travaillé sur l’évolution des vibrios en lien avec l’huître, mon projet de recherche s’est orienté ces dernières années vers l’étude des bases moléculaires des interactions entre les bactériophages et les vibrios. Les bactériophages, ou phages, représentent des acteurs importants de l’évolution bactérienne. Ces virus spécifiques des bactéries sont des parasites obligatoires, se répliquant uniquement dans leur hôte. L’infection par les phages virulents conduit à une lyse de la bactérie et constitue une pression de sélection de l’abondance et diversité bactérienne. Les phages tempérés sont capables de se maintenir dans leur hôte sous forme latente, pouvant induire des transferts de gènes intervenant par exemple dans l’antibiorésistance ou la virulence. Cependant, la façon dont la coévolution phages-vibrios dans l’environnement façonne l’évolution des génomes bactériens, entraîne des divergences entre populations et maintient la diversité au sein de ces populations demeure mal comprise.
CURSUS :
2007/2008 Post-Doctorat au Hollings Marine Laboratory, Medical University of South Carolina (Medical University of South Carolina, Charleston, Etats-Unis)
2006 Doctorat de biologie de l’Université de Bretagne Occidentale; Laboratoire de Physiologie des Invertébrés, IFREMER Brest (UMR 100 Ifremer – Université de Caen Basse-Normandie) : Financement : IFREMER / Région Bretagne.
Sujet: « Caractérisation de la virulence d’une souche de Vibrio aestuarianus, pathogène de l’huître Crassostrea gigas »; mention Très Honorable avec les Félicitations du Jury.
2002 DEA de Biologie Intégrée des invertébrés (Université Pierre & Marie Curie, Paris 6), Mention Bien.
1999 Diplôme d’Ingénieur en Agriculture, Ecole Supérieure d’Ingénieurs et Techniciens Pour l’Agriculture (ESITPA, Rouen)
PUBLICATIONS:
29- Lemonnier C., Chalopin M., Huvet A., Le Roux F., Labreuche Y., Petton B., Maignien L., Paul-Pont I., Reveillaud J. (2022) Time-series incubations in a coastal environment illuminates the importance of early colonizers and the complexity of bacterial biofilm dynamics on marine plastics. Environ Pollut.; 312:119994
28- Piel D., Bruto M., Labreuche Y., Blanquart F., Goudenège D., Barcia-Cruz R., Chenivesse S., Le Panse S., James A., Dubert J., Petton B., Lieberman E., Wegner K.M., Hussain F.A., Kauffman K.M., Polz M.F., Bikard D., Gandon S., Rocha E.P.C., Le Roux F. (2022) Phage-host coevolution in natural populations. Nat Microbiol.; 7(7):1075-1086.
27- Oyanedel D., Labreuche Y., Bruto M., Amraoui H., Robino E., Haffner P., Rubio T., Charrière G.M., Le Roux F. and Destoumieux-Garzón D.(2020) Vibrio splendidus O-Antigen structure: A tradeoff between virulence to oysters and resistance to grazers. Environ Microbiol. ; 22(10):4264-4278.
26- Piel D., Bruto M., James A., Labreuche Y., Lambert C., Janicot A., Chenivesse S., Petton B., Wegner K.M., Stoudmann C., Blokesch M., Le Roux F. (2019) Selection of Vibrio crassostreae relies on a plasmid expressing a type 6 secretion system cytotoxic for host immune cells. Environ Microbiol. 22(10):4198-4211.
25- Rubio T., Oyanedel D., Labreuche Y., Toulza E., Luo X., Bruto M., Chaparro C., Torres M., de Lorgeril J., Haffner P., Vidal-Dupiol J., Lagorce A., Petton B., Mitta G., Jacq A., Le Roux F., Charrière G.M., Destoumieux-Garzón D. (2019) Species-specific mechanisms of cytotoxicity toward immune cells determine the successful outcome of Vibrio infections. Proc Natl Acad Sci U S A.; 116(28):14238-14247
24- Koedooder C., Gueneugues A., Van Geersdaele R., Verge V., Bouget F.-Y., Labreuche Y., Obernosterer I., Blain S. (2018). The Role of the Glyoxylate Shunt in the Acclimation to Iron Limitation in Marine Heterotrophic Bacteria . Frontiers Marine Science ; 5(435)
23- Bruto M. & Labreuche Y. (co-1ers auteurs), James A., Piel D., Chenivesse S., Petton B., Polz M.F., Le Roux F. (2018) Ancestral gene acquisition as the key to virulence potential in environmental Vibrio populations. ISME J.; 12(12):2954-2966.
22- Labreuche Y., Chenivesse S., Jeudy A., Le Panse S., Boulo V., Ansquer D., Pagès S., Givaudan A., Czjzek M., Le Roux F. (2017). Nigritoxin is a bacterial toxin for crustaceans and insects. Nat Commun.; 8(1):1248.
21- Pauletto M., Segarra A., Montagnani C., Quillien V., Faury N., Le Grand J., Miner P., Petton B., Labreuche Y., Fleury E., Fabioux C., Bargelloni L., Renault T., Huvet A.(2017) Long dsRNAs promote an anti-viral response in Pacific oyster hampering ostreid herpesvirus 1 replication. J Exp Biol.; 220(Pt 20):3671-3685.
20- Bruto M., James A., Petton B., Labreuche Y., Chenivesse S., Alunno-Bruscia M., Polz M.F., Le Roux F. (2017) Vibrio crassostreae, a benign oyster colonizer turned into a pathogen after plasmid acquisition. ISME J.; 11(4):1043-1052.
19- Pham D., Charmantier G., Boulo V., Wabete N., Ansquer D., Dauga C., Grousset E., Labreuche Y. & Charmantier-Daures M. (2016) Ontogeny of osmoregulation in the Pacific blue shrimp, Litopenaeus stylirostris (Decapoda, Penaeidae): Deciphering the role of the Na(+)/K(+)-ATPase. Comp Biochem Physiol B Biochem Mol Biol.;196-197:27-37.
18- Petton B., Bruto M., James A., Labreuche Y., Alunno-Bruscia M., Le Roux F. (2015) Crassostrea gigas mortality in France: the usual suspect, a herpes virus, may not be the killer in this polymicrobial opportunistic disease. Front Microbiol.; 6:686.
17- Lemire A., Goudenège D., Versigny T., Petton B., Calteau A., Labreuche Y., Le Roux F.(2015) Populations, not clones, are the unit of vibrio pathogenesis in naturally infected oysters. ISME J.; 9(7):1523-31.
16- Goudenège D., Travers M.A., Lemire A., Petton B., Haffner P., Labreuche Y., Tourbiez D., Mangenot S., Calteau A., Mazel D., Nicolas J.L., Jacq A., Le Roux F.(2015) A single regulatory gene is sufficient to alter Vibrio aestuarianus pathogenicity in oysters. Environ Microbiol. 2015;17(11):4189-99
15- Pham D., Ansquer D., Chevalier A., Dauga C., Peyramale A., Wabete N., Labreuche Y. (2014) Selection and characterization of potential probiotic bacteria for Litopenaeus stylirostris shrimp hatcheries in New Caledonia. Accepté dans Aquaculture
14- Goudenège D., Labreuche Y., Krin E., Ansquer D., Mangenot S., Calteau A., Médigue C., Mazel D., Polz M.F., Le Roux F. (2013) Comparative genomics of pathogenic lineages of Vibrio nigripulchritudo identifies virulence-associated traits. ISME J., 7(10) :1985-96
13- Labreuche Y., Pallandre L, Ansquer D, Herlin J, Wapotro B, Le Roux F. (2012) Pathotyping of Vibrio isolates by multiplex PCR reveals a risk of virulent strain spreading in New Caledonian shrimp farms. Microb Ecol.;63(1):127-38
12- Le Roux F., Labreuche Y., Davis B.M., Iqbal N., Mangenot S., Goarant C., Mazel D., Waldor M.K. (2011) Virulence of an emerging pathogenic lineage of Vibrio nigripulchritudo is dependent on two plasmids. Environ Microbiol. ; 13(2):296-306.
11- Labreuche Y., Le Roux F., Henry J., Zatylny C., Huvet A., Lambert C., Soudant P., Mazel D., Nicolas J.L. (2010) Vibrio aestuarianus zinc metalloprotease causes lethality in the Pacific oyster Crassostrea gigas and impairs the host cellular immune defenses. Fish Shellfish Immunol.;29(5):753-8.
10- Labreuche Y., Veloso A., de la Vega E., Gross P.S., Chapman R.W., Browdy C.L., Warr G.W. (2010) Non-specific activation of antiviral immunity and induction of RNA interference may engage the same pathway in the Pacific white leg shrimp Litopenaeus vannamei. Dev Comp Immunol., 34(11):1209-18.
9- Labreuche Y., O’Leary N.A., de la Vega E., Veloso A., Gross P.S., Chapman R.W., Browdy C.L., Warr G.W. (2009) Lack of evidence for Litopenaeus vannamei Toll receptor (lToll) involvement in activation of sequence-independent antiviral immunity in shrimp. Dev Comp Immunol.; 33(7):806-10.
8- Montagnani C., Labreuche Y., Escoubas JM. (2008) Cg-IkappaB, a new member of the IkappaB protein family characterized in the pacific oyster Crassostrea gigas. Dev Comp Immunol.; 32(3):182-90.
7- Garnier M., Labreuche Y., Nicolas J.L. (2008) Molecular and phenotypic characterization of Vibrio aestuarianus subsp. francensis subsp. nov., a pathogen of the oyster Crassostrea gigas. Syst Appl Microbiol.;31(5):358-65
6- Lambert C., Soudant P., Jegaden M., Delaporte M., Labreuche Y., Moal J., Samain J.-F. (2007) In vitro modulation of reactive oxygen and nitrogen intermediate (ROI/RNI) production in Crassostrea gigas hemocytes. Aquaculture ; 270 (1–4) : 413-421
5- Labreuche Y., Lambert C., Soudant P., Boulo V., Huvet A., Nicolas J.L. (2006): Cellular and molecular hemocyte responses of the Pacific oyster, Crassostrea gigas, following bacterial infection with Vibrio aestuarianus strain 01/32, Microbes Infect.; 8 (12-13): 2715-2724
4- Garnier M., Labreuche Y., Garcia C., Robert M., Nicolas J.L. (2006): Evidence for the involvement of pathogenic bacteria in summer mortalities of the Pacific oyster Crassostrea gigas, Microb Ecol., 53 (2): 187-96
3- Labreuche Y., Soudant P., Gonçalves M., Lambert C., Nicolas J.L. (2005): Effects of extracellular products from the pathogenic Vibrio aestuarianus strain 01/32 on lethality and cellular immune responses of the oyster Crassostrea gigas, Dev Comp Immunol., 30 (4): 367-379
2- Huvet A., Herpin A., Degremont L., Labreuche Y., Samain JF., Cunningham C. (2004): The identification of genes from the oyster Crassostrea gigas that are differentially expressed in progeny exhibiting opposed susceptibility to summer mortality. Gene; 343: 211-20
1- Avarre J.C., Saulnier D., Labreuche Y., Ansquer D., Tietz A., Lubzens E. (2003): Response of Penaeus indicus females at two different stages of ovarian development to a lethal infection with Vibrio penaeicida, J Invertebr Pathol.; 82: 23-33.