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EDITO
Au nom de la direction de l’Unité IHPE, je souhaite la bienvenue à cette première édition de la newsletter de notre laboratoire élaborée par notre tout nouvel axe « valorisation ». Je remercie Anne et Jérôme d’avoir pris cette initiative qui a vocation à partager de l’’information au sein de notre unité et à mettre en valeur nos activités auprès de nos tutelles et partenaires.
L’année 2021, qui vient de commencer, sera marquée, nous l’espérons tous, par la fin de l’épidémie de Covid19 et nous allons tous collectivement continuer à surmonter cette épreuve. « L’année 2020 » a été particulièrement difficile pour nos jeunes collègues et je remercie nos tutelles et les porteurs des projets ANR d’avoir fait un effort considérable pour compenser une partie de temps perdu à cause de la pandémie en allouant des moyens supplémentaires équivalents à plus que 40 mois de salaire pour les doctorants et post-doctorants de notre unité.
L’année 2021 s’annonce pleine d’espoir. Un défi particulier pour l’Unité sera la réalisation des travaux de rénovation qui vont démarrer au printemps sur le site de Perpignan. Nos collègues de Montpellier savent très bien de quoi je parle ! Travailler avec le bruit des marteaux piqueur en douce musique de fond ne sera pas très plaisant mais nous serons récompensés en fin d’année avec un cadre de travail bien amélioré.
L’année 2021 sera aussi le point de départ pour l’Unité de la transition vers les approches de biologie des systèmes, accompagnée par un appel à projet interne IHPE lancé en janvier 2021. Notre unité se donne également l’objectif d’obtenir sur ce nouveau quinquennal des financements européens en tant que porteur et partenaire. Faisons en sorte de toucher l’horizon Europe !
Christoph Grunau, Directeur d’Unité
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CHEVALIERS DE L’ORDRE NATIONAL DU MERITE
C’est la récompense que l’UPVD a obtenue pour nos collègues David Duval, Benjamin Gourbal et Guillaume Mitta pour leur implication dans le dépistage PCR de la covid-19 au printemps 2020.
L’ordre national du Mérite est le second ordre national visant à honorer les citoyens français, après la Légion d’honneur. Il récompense les mérites distingués soit dans une fonction publique, civile ou militaire, soit dans l’exercice d’une activité privée.
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NOUVEAU DEPART
Julien de Lorgeril (chercheur Ifremer de l’IHPE) a rejoint début 2021 l’Unité de Recherche Ifremer Lagons, Ecosystèmes et Aquaculture Durable (LEAD) sur un poste de Chercheur en Ecopathologie en Nouvelle Calédonie.
Il travaillera sur les interactions hôtes-pathogènes-environnements dans des contextes de maladies infectieuses affectant la crevette Litopenaeus stylirostris
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VICE-PRESIDENT VALORISATION DE LA RECHERCHE ET ENTREPRENEURIAT UPVD
Jérôme Boissier, chercheur IHPE vient d’être nommé « VP Valo » par le nouveau Président de l’Université de Perpignan.
Le vice-président à la valorisation de la recherche coordonne l’ensemble des activités de valorisation de l’Université sous l’autorité du Président et en relation avec la Vice-présidence recherche. La valorisation de la recherche se situe comme un point de liaison entre l’Université et le tissu industriel, socio-économique et culturel. Le vice-président valorisation a en charge le suivi du processus de valorisation : de la détection des projets dans les laboratoires, l’accompagnement et les différents modes de transfert jusqu’à l’appropriation sociale, culturelle ou industrielle/économique des résultats de la recherche tout en veillant à la préservation du patrimoine intellectuel de l’Université. Il accompagne les différentes initiatives en matière d’entrepreneuriat qu’il s’agisse des étudiants ou des personnels
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ASSISTANT INGENIEUR
Jean-François Allienne vient d’obtenir la promotion interne d’assistant-ingénieur au CNRS.
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NOUVEAUX ARRIVANTS
6 nouveaux doctorants pour cette promotion
Equipe MIA
Cécile Blanchon qui vient de l’INSA de Toulouse et va travailler avec Eve Toulza en cotutelle avec le labo BAE de Perpignan
Manon Blin qui a fait son master à l’IHPE et va travailler avec Jérôme Boissier à Perpignan
Philippe Douchet qui a fait son master à l’IHPE et va travailler avec Jérôme Boissier et Olivier Rey à Perpignan
Équipe 2MAP
Louis Boismorand qui vient de l’Université de la Sorbonne et va travailler avec Guillaume Mitta et Jérémie Vidal-Dupiol à Montpellier
Pierre Poteaux qui a fait son master à l’IHPE et va travaille avec David Duval et Benjamin Gourbal à Perpignan
Elodie Simphor qui vient de Montpellier et va travailler avec David Duval et Benjamin Gourbal à Perpignan
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PERPIGNAN
Le bâtiment de la plateforme Bio-Environnement vient d’être livré à l’Université de Perpignan.
Le matériel est en installation ainsi que le personnel des laboratoires IHPE et LGDP.
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MONTPELLIER
Après 8 mois de travaux, les nouveaux locaux du site de Montpellier sont opérationnels depuis septembre 2020 : bureaux, salles de réunion et laboratoires
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THESE
Nelia Luviano Aparicio a soutenu sa thèse le 29 janvier 2021
La méthylation de l’ADN chez Biomphalaria glabrata, rôle et impact sur la génération de la plasticité phénotypique
Résumé
La compréhension des mécanismes moléculaires qui permettent l’adaptation rapide des mollusques vecteurs de parasites à de nouveaux environnements est importante pour le contrôle des maladies. Il existe des preuves solides qui soutient que les mécanismes épigénétiques sont à l’origine des adaptations rapides chez plusieurs espèces. J’ai me suis focalisé sur une marque épigénétique appelée la méthylation de l’ADN, qui est modulée par l’environnement et joue un rôle dans la plasticité phénotypique chez de nombreuses espèces, principalement les plantes et les vertébrés. Néanmoins, le rôle de la méthylation de l’ADN dans la génération de variations phénotypiques chez les invertébrés a été très peu étudié. J’ai abordé la question du rôle de la méthylation de l’ADN dans la génération de la plasticité phénotypique et de son héritabilité chez l’escargot B. glabrata, l’hôte intermédiaire du parasite Schistosoma mansoni, l’agent pathogène de la schistosomiase, une maladie tropicale négligée. La méthylation de l’ADN chez B. glabrata est régulée par l’infection du parasite S. mansoni et par le stress environnemental, de plus, il a été démontré que la méthylation de l’ADN affecte son expression génique, suggérant que la méthylation de l’ADN peut affecter la variation phénotypique et donc l’adaptation de l’escargot à de nouveaux environnements. Pour étudier le rôle de la méthylation de l’ADN dans la génération de la variation phénotypique, deux approches ont été proposées dans cette thèse pour introduire des épimutations chez l’escargot B. glabrata: 1) Épimutagenèse aléatoire en utilisant des inhibiteurs chimiques de DNMTs et par ségrégation conséquente des épimutations dans les lignées d’autofécondation et 2) Par la méthylation des cytosines d’un locus ciblé avec un outil d’édition épigénétique qui consiste à l’utilisation d’une vecteur plasmidique codant pour l’ADN méthyltranférase de novo (DNMT3) fusionnée avec l’enzyme dCas9 (Cas9 avec l’activité nucléase désactivé). Pour l’approche d’épimutagenèse aleatoire, un nouvel inhibiteur des enzymes DNMT a montré des effets d’inhibition de la méthylation dans deux générations consécutives, en montrant un effet épigénétique multigénérationnelle et sans montrer d’effet toxique ni dans la survie ni dans la fécondité de l’escargot B. glabrata. De plus l’inhibiteur Flv1 a montré être efficace dans deux autres espèces de mollusques, l’escargot d’eau douce Physa acuta et l’huître creuse Crassostrea gigas, ce qui suggère que cet inhibiteur représente un potentiel outil moléculaire pour moduler la méthylation de l’ADN chez les mollusques et potentiellement chez d’autres invertébrés qui présentent une méthylation dans le contexte CpG dans leur génome. Dans le cas de l’approche d’épimutagénèse ciblé, j’ai testé plusieurs méthodes de transfection et j’ai trouvé une méthode de transfection qui permet d’introduire deux vecteurs plasmidiques avec un promoteur viral SV40 de façon in vivo dans un embryon de l’escargot B. glabrata. La transfection a été effectuée un stade tardif du développement, au stade gastrula, ce qui a entrainé une incorporation mosaïque du vecteur dans les cellules transfectés. Toutefois, la méthode a permis de méthyler certains sites CpG du gène ciblé. |
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PRODUCTION 2021
Parus :
- Environment International (Destoumieux-Garzon)
- Genes MDPI (Rey)
- Global Ecoloy & Conservation (Mulero, Toulza, Allienne, Rey, Boissier)
- Journal of Proteomics (Lagorce)
- Trends in Parasitology (Gourbal, Boissier)
- Wellcome Open Research (Augusto, Rey, Chaparro, Vidal-Dupiol, Allienne, Duval, Grunau)
Sous presse :
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MISSIONS / CONGRES
- Anne Rognon & Jérôme Boissier à Maisons-Alfort pour la 3e infestation de moutons du projet HySWARM
- Guillaume Mitta & Jérémie Vidal-Dupiol à Argenton pour des échantillons d’huîtres dans le cadre du contrat DECICOMP
- Louis Boismorand à Brest pour maniper au Centre Ifremer de Bretagne (contrat DECICOMP)
- Maurine Hammel & Erika Burioli à Caen: expérimentation Labeo pour le projet TRANSCAN
- Louis Boismorand et Carolane Giraud ont participé au congrès des doctorants Ifremer le 29 janvier dernier avec une présentation en 5mn de leur sujet de thèse
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SEMINAIRE
9 février 14h zoom [ Affiche ]
Paulina SCHMITT (Univ. Valparaiso Chili)
Host Defense Effectors Expressed by Hemocytes Shape the Bacterial Microbiota From the Scallop Hemolymph
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BOITE A OUTILS
Retrouvez tous les documents utiles à la vie de labo dans l’intranet IHPE.
logos, modèles de présentation, liste des congrès 2021, liste des réunions, liste des appels à projets, procédures de demandes de formation, espace doctorants, comptes-rendus de réunions …
Demandez s’il en manque !
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