|
|
Bienvenue à Anaïs DUFAU, qui débute au 1er décembre sa thèse «Mécanismes et conséquences évolutives des phénomènes d’hyperploïdisation dans le cadre du cancer transmissible de la moule bleue» sous la direction de Viviane BOULO et Erika BURIOLI à IHPE et Nicolas BIERNE de l’ISEM. |
|
|
Bertrand DE L’ISLE, vient d’être élu Président de l’Association des Doctorants de l’Université de Perpignan « UPVDOC« |
|
|
Retour sur la thèse de Pierre POTEAUX
Le 25 novembre, Pierre POTEAUX a soutenu sa thèse intitulée « Structure-fonction de toxines de type aérolysine chez Biomphalaria glabrata et Schistosoma mansoni » à l’Université de Perpignan.
Au programme à venir : un post-doctorat aux USA pour le printemps…Félicitations Pierre et Bonne route ! |
|
|
Retour sur la thèse de Léo DUPERRET
Le 10 décembre, Léo DUPERRET a soutenu sa thèse intitulée » Quelles sont les modifications fonctionnelles des espèces bactériennes présentes dans l’huître sous différentes conditions de permissivité au Pacific Oyster Mortality Syndrome (POMS) ? » à l’Université de Perpignan. Félicitations Léo ! |
|
|
Retour sur la thèse de Sébastien DE LA FOREST DIVONNE
Le 13 décembre, Sébastien DE LA FOREST DIVONNE a soutenu sa thèse intitulée « Caractérisation de la diversité fonctionnelle et ontogénique des cellules immunitaires de Crassostrea gigas par séquençage d’ARNm sur cellules uniques » sur le campus CNRS de Montpellier. Félicitations Sébastien ! |
|
|
Retour sur la thèse de Mathilde JAQUET
Le 18 décembre, Mathilde JAQUET a soutenu sa thèse intitulée « Le microbiote des hôtes intermédiaires escargots et des arthropodes vecteurs de zoonose sous contraintes génétiques et environnementales : une approche de la capacité vectorielle » sur le campus de l’Université de Perpignan. Félicitations Mathilde ! |
|
|
Félicitations à Célia KOELLSCH, Jérôme BOISSIER et Ronaldo DE CARVALHO AUGUSTO qui ont reçu le prix du meilleur poster pour leur travail « Dynamics of malaria – schistosomiasis co-infection: what is the immune impact on the mouse mammal host ? » lors du congrès Infection & Immunity Meeting qui s’est déroulé à Montpellier |
|
|
PERPIGNAN : Echanges avec le Ghana
Du 9 au 13 décembre, Jérôme BOISSIER et Boris SAVASSI recevaient une délégation Ghanéenne du Noguchi Memorial Institute for Medical Research. Ce centre, ainsi que le laboratoire CREMIT du Bénin, fait partie du Laboratoire Mixte International CONS-HELM auxquels nous sommes associés.
Nous avons reçu le Pr William ANYAN accompagné de deux doctorantes, Ninette OWUSU-ADZORAH et Ivi BENTIL ainsi que David COURTIN (IRD, Intertryp) partenaire de l’ANR AfzoonS « African Zoonotic Schistosomiasis : a paradigm shift » (2025-2028).
Cette visite financée par l’ambassade de France au Ghana a permis à nos collègues Ghanéens de se former à la détection moléculaire d’hybrides de Schistosoma.
Jérôme BOISSIER est ensuite parti au Ghana du 8 au 16 décembre pour visiter les sites de transmission et discuter de projets futurs. |
|
|
MONTPELLIER : Formation MAGE
Du 2 au 5 décembre, s’est tenue dans les locaux d’IHPE Montpellier une formation « MAGE Annotation et analyse de génomes procaryotes – Mise en oeuvre de la plateforme microscope.
Il s’agissait d’une formation dite « intra-entreprise » : organisée par et pour le laboratoire avec des formateurs extérieur, avec un co-financement des tutelles et du labo. Une grande première pour nous !
La formation d’une durée de 3.5 jours a concerné 7 personnes des 4 tutelles de l’unité. |
|
|
Collaboration avec le Brésil
Le mois dernier, en route vers le 17º International Symposium on Schistosomiasis au Brésil, Ronaldo DE CARVALHO AUGUSTO et Christoph GRUNAU ont rencontré le Dr Clalia MELLO-SILVA (cheffe du laboratoire d’évaluation et de promotion de la santé environnementale, FIOCRUZ IOC Rio de Janeiro) et Norma BRANDAO (vice-directrice de l’éducation, de l’information et de la communication du FRIOCRUZ) pour la préparation d’un « Memorandum of Understanding » (MoU) entre le FIOCRUZ et l’Université de Perpignan Via Domitia. |
|
|
Collaboration Semaine du Roussillon
Nous vous l’annoncions le mois dernier, un partenariat a été signé entre l’Université de Perpignan et le journal « La semaine du roussillon » afin de produire régulièrement des articles de vulgarisation scientifique avec les chercheurs des laboratoires du campus.
Le 1er article IHPE vient de sortir : « Une perspective pour lutter contre les maladies infectieuses des huîtres »
co-rédigé par Céline Cosseau, Marie-Agnès Travers, Eve Toulza, Jérémie Vidal-Dupiol et Luc Dantan et paru le 05/12/2024. |
|
|
HCERES rédaction du rapport
Cette fois c’est parti, la rédaction du bilan 2019-2024 d’IHPE est en cours au sein des équipes, des services et de la direction.
Le document est à rendre en février à l’Université de Perpignan qui sera dépositaire du dossier auprès du HCERES
Bon courage à tous ceux qui oeuvrent et patience pour les autres ! |
|
|
| 
|
Retour sur le Workshop interne EPIGENETIQUE
Le workshop IHPE sur l’Epigénétique s’est tenu le 29 novembre, abordant une grande diversité de thématiques mêlant approches méthodologiques et questionnements scientifiques. Arnaud LAGORCE a présenté les mécanismes de méthylation de l’ADN chez les bactéries, en soulignant les limites actuelles des outils comme le séquençage Nanopore. Jérémie VIDAL-DUPIOL a évoqué une technique de capture permettant de réduire les coûts de séquençage bisulfite, grâce à laquelle il a pu démêler et quantifier les relations entre variations génétiques, épigénétiques (méthylation de l’ADN) et phénotypiques chez l’huître. Alejandro VALDIVIESO a comparé deux approches bioinformatiques pour l’agrégation des données, MOFA et WGCNA, en fonction des besoins analytiques, tandis qu’Amélie DELLONG a discuté des avancées techniques dans les méthodes ATAC-Seq et Cut&Tag visant à relier la structure de la chromatine aux compartiments méthylés et non méthylés du génome de l’huître. Christoph GRUNAU a présenté une stratégie optimisée pour la titration en ATAC-Seq, permettant de réduire les coûts grâce à une production interne de Tn5. Enfin, Céline COSSEAU a mis en évidence des différences épigénétiques entre les stades larvaires et juvéniles de l’huître, détectées par spectrométrie de masse des modifications des histones.
La demi-journée s’est conclue sur l’importance d’échanger plus régulièrement autour des avancées conceptuelles et techniques en épigénétique, idéalement tous les deux mois, afin d’acquérir et de diffuser de nouvelles connaissances ainsi que des outils bioinformatiques pour l’analyse de la méthylation de l’ADN chez les bactéries, les technologies Nanopore et l’intégration des données multi-omiques. Julie CLEMENT et Cristian CHAPARRO se chargent désormais de l’organisation des tables rondes thématiques sur ces sujets, qui auront lieu une fois par mois, les vendredis à 9h15, par Zoom dans le créneau de la table ronde Bioinfo. Venez nombreuses et nombreux ! |
|
|
RAPPEL groupes de travail
Suite aux présentations faites lors de la dernière journée scientifique du 28 novembre à Montpellier, un rappel des groupes de travail en cours, que vous pouvez rejoindre à tout moment – QVCT Qualité de Vie et des Conditions de Travail : ce groupe va maintenant être coaché par un professionnel et accompagné pendant le 1er semestre 2025 par une stagiaire du DU qualité de vie au travail de Toulouse.
Contact : Jean-Michel ESCOUBAS – Yes Wiki Gare Centrale : pour résumer « un intranet collaboratif ».
Contact : Anne MODAT
Demande de création de compte : Rémi EMANS |
|
|
Lien éditeur depuis le litre, Lien plein texte depuis HAL - Microbial education plays a crucial role in harnessing the beneficial properties of microbiota for infectious disease protection in Crassostrea gigas (Dantan, Travers, Allienne, Courtay, Romatif, Pouzadoux, Vidal-Dupiol, Toulza, Cosseau) HAL 04813579
- Detection, quantification, and characterization by whole-slide image analysis of bacterial infection by Vibrio aestuarianus, stained by immunohistochemistry, in the pacific oyster Magallana gigas (Travers) HAL 04829499
- Environmental factors and potential probiotic lineages shape the active prokaryotic communities associated with healthy Penaeus stylirostris larvae and their rearing water (Boulo) HAL 04847616
Rappels :
– consultez la charte IHPE sur l’ intranet avant de soumettre un article
– retrouvez toute la production d’IHPE sur la plateforme d’archives ouvertes HAL |
|
|
A noter dans vos agendas neufs ! Les grands rendez-vous de l’année coorganisés par les membres du laboratoire : – JANVIER : Journée Modélisation en biologie (France)
– FEVRIER : Gordon Research Conference « Antimicrobial Peptides » (USA)
– MAI : EpiMar 2025 (Espagne) |
|
|
COMITE EDITORIAL
Directeur de publication : Christoph Grunau
Jérôme Boissier, Delphine Destoumieux-Garzon, Caroline Montagnani, Anne Modat
Crédits photographiques IHPE ou précisé
S’abonner/ Se désabonner |
|
|
| |
|
