IHPE UMR 5244 Université de Montpellier Place Eugène Bataillon CC 80 F-34095 Montpellier Cedex 5 Tel +33(0)4-67-14-37-26 Fax +33(0)4-67-14-46-22 email : laura.onillon@ifremer.fr |
GRADE : Doctorante UM
ECOLE DOCTORALE : Montpellier ED 584 : GAIA
ENCADRANTS : Marie-Agnès TRAVERS & Guillaume CHARRIERE
EQUIPE : TREV
RESEAUX SOCIAUX PROFESSIONNELS :
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SUJET DE THESE :
Étude du rôle des interactions amibes – vibrios en milieu marin dans l’émergence des pathogènes.
MOTS CLES :
Interactions hôtes-pathogènes ; Amibes libres ; Vibrios ; Phagocytose ; Huîtres.
PROJET DE THESE :
En milieu marin, les amibes libres se nourrissent de bactéries grâce à la phagocytose. Par ailleurs, ce processus cellulaire a été conservé au cours de l’évolution et est également utilisé par les cellules immunitaires des animaux pour la défense contre les pathogènes. Dès lors, la prédation exercée par les amibes libres sur les bactéries aquatiques pourrait favoriser la sélection de pathogènes résistants à la phagocytose. Depuis 2008, le syndrome de mortalité des huîtres du Pacifique (POMS) entraine d’importants épisodes de surmortalité chez l’huitre creuse Crassostrea gigas. A l’origine de ces épisodes, une immunosuppression induite par le virus OsHV-1 µvar favorise la colonisation des huîtres par des bactéries pathogènes opportunistes du genre vibrio. Or, ces pathogènes peuvent résister à la phagocytose des cellules immunitaires des huîtres, ou hémocytes, et entrainer leur lyse. De plus, de précédents travaux ont montré que des facteurs de virulence de Vibrio tasmaniensis LGP32 chez l’huître sont également impliqués dans la résistance de cette souche à la prédation des amibes libres. On sait notamment qu’une pompe d’efflux du cuivre (CopA) est nécessaire à la survie intracellulaire des vibrios, et qu’une métalloprotéase sécrétée (Vsm) provoque une inhibition de la motilité amibienne. L’objectif de ce projet est ainsi de mieux comprendre le rôle joué par les interactions amibes-vibrios en milieu marin dans l’émergence de virulence chez les vibrios pathogènes d’huitre. La première partie de la thèse sera consacrée à la caractérisation des vibrios associés aux amibes dans l’environnement. Pour cela, des collections d’amibes marines d’origines géographiques diverses seront criblées par qPCR spécifique des Vibrionaceae, et les groupes taxonomiques auxquels appartiennent les vibrios seront ensuite déterminés par séquençage et analyse en génomique comparative. Deuxièmement, une banque de mutants transposons de V. tasmaniensis LGP32 et Vibrio crassostreae J2-9 permettra d’identifier à l’échelle du génome les facteurs de virulence impliqués dans les interactions vibrio-amibes et/ou vibrio-huitres. Enfin, une approche par évolution expérimentale permettra d’étudier les changements évolutifs résultants d’interactions successives amibes-vibrios, ainsi que leur impact sur la virulence des vibrios chez l’huitre.
ENSEIGNEMENT :
Vacations IUT Montpellier / Sète hématologie et immunologie
CURSUS :
2021 Master 2 Biologie Santé, parcours Microbiologie Immunologie, Université de Montpellier
2015-2021 Etudes de pharmacie, Université d’Angers
2015 Baccalauréat Scientifique, spécialité SVT , Lycée Saint Joseph Ancenis
PUBLICATIONS :
Articles dans une revue
- Marija V Demiankova, Fabio Giovannercole, Maxim A Khomutov, Arthur I Salikhov, Laura Onillon, et al.. Antibacterial Activity of Peptide Derivatives of Phosphinothricin against Multidrug-Resistant Klebsiella pneumoniae. Molecules, 2023, 28, pp.1234. ⟨10.3390/molecules28031234⟩. ⟨hal-04279764⟩
- Maxim A Khomutov, Fabio Giovannercole, Laura Onillon, Marija V Demiankova, Byazilya F Vasilieva, et al.. A Desmethylphosphinothricin Dipeptide Derivative Effectively Inhibits Escherichia coli and Bacillus subtilis Growth. Biomolecules, 2023, 13, pp.1451. ⟨10.3390/biom13101451⟩. ⟨hal-04279776⟩