IHPE UMR 5244 Université de Perpignan via Domitia 52 Avenue Paul Alduy F-66860 Perpignan Cedex Tel +33(0)4-68-66-20-50 Fax +33(0)4-68-66-22-81 email : luc.dantan@univ-perp.fr |
GRADE : Doctorant UPVD
ECOLE DOCTORALE : Perpignan ED 305 : Energie Environnement
ENCADRANTS : Céline COSSEAU, Eve TOULZA, Yannick GUEGUEN
EQUIPE : TREV
RESPONSABILITES :
Membre élu au Conseil de Laboratoire (collège A Chercheurs et Enseignants-Chercheurs, sous-collège non-permanents)
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RESEAUX SOCIAUX SCIENTIFIQUES :
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SUJET DE THESE :
Caractérisation des Effets Immunomodulateurs de la Microflore Naturelle de l’Huître Crassostrea gigas et Développement de Probiotiques pour la Conchyliculture.
MOTS CLES :
Crassostrea gigas, microflore, probiotique, immunomodulation, compétition positive.
PROJET DE THESE :
De plus en plus d’études récentes montrent que l’unité de sélection évolutive n’est pas l’individu isolé mais l’holobionte, c’est-à-dire l’animal ou la plante avec tous les microorganismes qui lui sont associés. Les microorganismes sont bénéfiques pour la survie, la nutrition, l’homéostasie et le développement des hôtes auxquels ils sont associés. Tout particulièrement, le rôle immunomodulateur de certaines bactéries commensales a été mis en évidence chez les mammifères et la commercialisation de bactéries sous forme de probiotiques est largement appliquée en prophylaxie en santé humaine. Chez les organismes marins d’intérêt économique, plusieurs études rapportent la possibilité d’étendre l’utilisation de probiotiques aux pratiques d’élevage aquacole, y compris en conchyliculture. L’intensification de l’aquaculture et l’apparition de crises sanitaires sur les élevages ont encouragé la recherche à développer des solutions durables sans compromettre l’environnement (alternatives aux antibiotiques) afin d’enrayer les maladies. C’est ainsi que l’utilisation de probiotiques s’est étendue à l’aquaculture et a montré des résultats prometteurs. Toutefois ces applications concernent essentiellement les élevages piscicoles et la culture des crevettes. Très peu d’études se sont consacrées à la mise en application sur des élevages conchylicoles. L’huître C. gigas subit depuis 2008 des épisodes de mortalités massives menaçant la filière ostréicole française. Dans le cadre de l’étude de ces mortalités estivales, nous avons caractérisé l’étiologie d’une des maladies survenant sur les stades juvéniles (Pacific Oyster Mortality Syndrome, POMS). Nous avons montré qu’une bactériémie sévère opportuniste était à l’origine des mortalités et qu’elle survenait suite à une déstabilisation du microbiote conséquente à une immunodépression des huitres causée par l’infection avec le virus OsHV-1 μVar. Par ailleurs, nous avons montré qu’il était possible de stimuler les défenses immunitaires des huitres en les traitants avec une microflore environnementale au cours de leur développement larvaire. Cette stimulation permet aux huitres de mieux survivre lors d’un épisode infectieux. Egalement, nous avons montré que des huitres résistantes présentent, en période infectieuse en milieu naturel, une association systématique avec un groupe spécifique de cyanobactéries, suggérant un rôle protecteur de ces bactéries au cours de la pathogénèse potentiellement par compétition positive. Ces résultats ouvrent les perspectives d’un champ d’application pour l’usage de probiotiques appliqués à l’ostréiculture.
La thèse proposée se fera dans la suite de ces travaux, les études envisagées auront pour objectif:
– Identifier et générer une collection d’espèces bactériennes préférentiellement associées aux huitres ayant une meilleure survie lors d’épisode infectieux (Partie 1)
– Caractériser l’effet immunomodulateur de ces bactéries sur les huitres (Partie 2)
– Proposer une formule probiotique permettant de répondre aux besoins de la profession (partie 3)
CURSUS :
2019 Master 2 de Microbiologie parcours Mécanismes Moléculaires Microbiens. Université de Caen Normandie et Université de Rouen Normandie. (mention AB)
2018 Master 1 de Microbiologie. Université de Caen Normandie (mention AB)
2017 Licence de biologie parcours Microbiologie. Université de Caen Normandie
2012 Baccalauréat Technologique série Sciences et Technologie de Laboratoire, spécialité chimie de laboratoire et procédés industriels. Toulouse (mention AB)
PUBLICATIONS :
Articles dans une revue
- Delphine Destoumieux-Garzón, Caroline Montagnani, Luc Dantan, Noémie de San Nicolas, Marie-Agnès Travers, et al.. Cross-talk and mutual shaping between the immune system and the microbiota during an oyster's life. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, 2024, 379 (1901), ⟨10.1098/rstb.2023.0065⟩. ⟨hal-04515139⟩
- Luc Dantan, Eve Toulza, Bruno Petton, C. Montagnani, Lionel Dégremont, et al.. Microbial education for marine invertebrate disease prevention in aquaculture. Reviews in Aquaculture, In press, pp.1-15. ⟨10.1111/raq.12893⟩. ⟨hal-04470074⟩
- Manon Fallet, C. Montagnani, Bruno Petton, Luc Dantan, Julien de Lorgeril, et al.. Early life microbial exposures shape the Crassostrea gigas immune system for lifelong and intergenerational disease protection. Microbiome, 2022, 10, pp.85. ⟨10.1186/s40168-022-01280-5⟩. ⟨hal-03635473v2⟩
- Noémie de San Nicolas, Aromal Asokan, Rafael D Rosa, Sébastien N Voisin, Marie-Agnès Travers, et al.. Functional Diversification of Oyster Big Defensins Generates Antimicrobial Specificity and Synergy against Members of the Microbiota. Marine drugs, 2022, 20 (12), pp.745. ⟨10.3390/md20120745⟩. ⟨hal-04246173⟩
- Mohamed Boukerb, Cyril Noël, Emmanuelle Quenot, Bernard Cadiou, Julien Chevé, et al.. Comparative Analysis of Fecal Microbiomes From Wild Waterbirds to Poultry, Cattle, Pigs, and Wastewater Treatment Plants for a Microbial Source Tracking Approach. Frontiers in Microbiology, 2021, 12, 697553 (21p.). ⟨10.3389/fmicb.2021.697553⟩. ⟨hal-04203543⟩
Communications dans un congrès
- Noémie de San Nicolas, A. Asokan, R.D. Rosa, S.N. Voisin, Marie Agnès Travers, et al.. Functional DIversification of Big-Defensins and the shaping of oyster microbiota. AMP 2022 7th International Symposium on Antimicrobial Peptides, Nov 2022, Paris, France. ⟨hal-03976756⟩
- Luc Dantan, Eve Toulza, Yannick Gueguen, Lionel Dégremont, Benjamin Morga, et al.. Protective effect of bacteria isolated from the natural microbiota of the Pacific oyster Crassostrea gigas against OsHV-1 µvar and Vibrio aestuarianus infections. Joint Meeting ISS 10 & Holobionts 3, International Society of Symbiosis; Holobionts Conference, Jul 2022, Lyon, France. ⟨hal-03971568⟩
Poster de conférence
- Luc Dantan, Eve Toulza, Yannick Gueguen, Lionel Dégremont, Benjamin Morga, et al.. Protective effect of bacteria isolated from the natural microbiota of the Pacific oyster Crassostrea gigas against OsHV-1 µvar and Vibrio aestuarianus infections. MicrobiOccitanie 2022, 3e rencontre des laboratoires de microbiologie de la région Occitanie, Jul 2022, Toulouse, France. . ⟨hal-03976718⟩
- Luc Dantan, Eve Toulza, Yannick Gueguen, Lionel Dégremont, Benjamin Morga, et al.. Protective effect of bacteria isolated from the natural microbiota of the Pacific oyster Crassostrea gigas against OsHV-1 µvar and Vibrio aestuarianus infections. 6th international symposium on genomics in aquaculture GIA 2022, May 2022, Grenade, Spain. . ⟨hal-03971532⟩