Equipe MIA : Micro-évolution des Interactions dans l’Anthropocène

L’équipe MIA s’intéresse aux réponses adaptatives (au sens large) rapides des populations naturelles aux changements globaux, que ce soit les modifications des conditions abiotiques (e.g.  réchauffement climatique) ou des interactions biotiques (e.g. émergence de pathogènes), et vise à proposer en réponse à cet enjeu majeur de l’Anthropocène de nouvelles mesures de gestion des écosystèmes.
Les écosystèmes sont des systèmes dynamiques qui souffrent aujourd’hui de nombreuses perturbations d’origine anthropique. L’équipe se concentre sur l’étude des des populations et des communautés et leurs réponses adaptatives rapides (sensu lato) aux changements biotiques et abiotiques contemporains. Cette courte échelle évolutive s’étend de la durée de vie de l’organisme, que nous considérons en tant qu’holobionte, à un petit nombre de générations. Nos approches sont principalement axées sur les populations naturelles mais incluent également des expérimentations in natura et en mésocosmes. Nous considérons toutes les modifications permettant des adaptations rapides potentielles : les variations au niveau génomique (mutations, variations du nombre de copies de gènes, introgression), les variations épigénomiques (dynamique des éléments transposables, modifications des histones, méthylation), ainsi que les modifications taxonomiques et fonctionnelles du microbiote. Nos recherches, qui considèrent l’organisme en tant que composante de l’écosystème et les liens entre la santé (médicale et vétérinaire) et l’environnement, entrent dans le cadre de l’approche « One Health – une seule santé ». Nous utilisons également des outils de modélisation épidémiologique et mathématique pour anticiper le devenir de ces interactions changeantes entre les organismes et leurs environnements. Les connaissances fondamentales acquises lors de nos études visent à proposer des mesures de gestion des écosystèmes en étroite collaboration avec les sciences sociales et les parties prenantes.

Responsables :
TOULZA Eve, Maître de Conférences Univ. Perpignan
VIDAL-DUPIOL Jérémie, Chercheur Ifremer

Personnel permanent :
BOISSIER Jérôme, Professeur Univ. Perpignan
KY Chin-Long, Chercheur Ifremer
LANGAND Juliette, Maître de Conférence Univ. Perpignan
MONTAGNANI Caroline, Chercheuse Ifremer
PICARD Marion, Maître de Conférence Univ. Perpignan
REY Olivier, Maître de Conférence Univ. Perpignan

Personnel non permanent :
VALDIVIESO Alejandro, Post-doctorant CNRS
BEN HADID Nadia, ATER Univ. Perpignan

BUSO Pauline, Doctorante Ifremer
MERCIER LARRIBE Chiara, Doctorante Univ. Perpignan
EL KALAÏ Samira, Doctorante Univ. Montpellier
JAQUET Mathilde, Doctorante  Univ. Perpignan

Personnel parti dernièrement :
VAZQUEZ Antonio, ATER Univ. Perpignan
BLANCHON Cécile, Doctorante Univ. Perpignan
BLIN Manon, Doctorante Cifre-Univ. Perpignan
AGNIWO Privat, Doctorant Univ. Mali
LUVIANO APARICIO Nelia, Post-doctorante Univ. Perpignan
SAVASSI Boris, Post-doctorant Campus France

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Nationaux

ANR PRC PRIMOYSTER (2022-2026) Investigation of immune priming in Oyster to prevent the Pacific Oyster Mortality Syndrome
Coordinatrice de projet : Caroline Montagnani
Partenaires : IHPE-TREV / IHPE-2MAP/ ASIM/ UMR LEMAR/ UMR MARBEC/ UBS

ANR PRCE ORMER (2023-2027) Préserver et valoriser les populations d’ormeaux : un élément clé du socio-écosystème des pêcheries côtières et de l’halioticulture de l’ouest de la France
Responsable scientifique IHPE : Agnès Travers
Coordinatrice : Sabine Roussel
Partenaires: IHPE-TREV / UBO / OFB / France Haliotis

ANR PRCE Projet de Recherche Collaborative – Entreprise : SPOC (2022-2026) Evaluation et quantification de l’impact de la pollution aux filtres solaires sur le corail
Porteur de projet : Philippe Lebaron
Partenaires scientifiques : Observatoire Océanologique de Banyuls : Laboratoire Pierre Fabre

ANR : HySWARM (2018-2023) Hybrid swarm, the role of hybridization in the invasive capacity, epidemiology and diagnosis of schistosomiasis
Porteur de projet : Jérôme Boissier
Responsable scientifique IHPE : Jérôme Boissier
Partenaires :  BIPAR-ENVA Paris  /  INSERM-CPTP Toulouse  /  LDBIO DIAGNOSTICS Lyon

CHANEL : POEMA (2021-2025) Accompagnement vers une production améliorée et éco-responsable de produits perliers CHANEL à partir de l’huître perlière P. margaritifera
Porteur de projet : Chin-Long Ky
Responsable scientifique IHPE : Chin-Long Ky
Partenaires :  RMPF

Fonds Européen pour les Affaires Maritimes et la Pêche : GestInnov (2021-2023) Gestion innovante et durable des mortalités d’huîtres
Porteur de projet : Jérémie Vidal-Dupiol
Responsable scientifique IHPE : Jérémie Vidal-Dupiol
Partenaires : ASIM /Ets Papin / Ets MediThau / RMPF

Institutionnels

CEMEB PolFishCor (2023-2024) A multidisciplinary approach to test the impacts of wastewater pollution and corallivory by fish on coral health
Porteur de projet : Sébastien Villeger & Eve Toulza
Partenaires : MARBEC Montpellier

FREE2043 + Ecole doctorale 305 : LAGUNE (2019-2023) Thèse Cécile Blanchon : Evaluation des interactions entre contaminants organiques, communautés microbiennes et l’huître Crassostrea gigas en microcosmes et mésocosmes traités sous conditions photo-oxydatives contrôlées.
Porteur de projet : Christophe Calvayrac, Gaël Plantard & Eve Toulza
Responsable scientifique IHPE : Eve Toulza
Partenaires : BAE-LBBM Perpignan  /  PROMES Perpignan

FREE2043 : ParaPO (2020-2021) La gestion de la transmission des parasites des troupeaux, Fasciola hepathica et Calicophoron daubenyi, sur les estives des Pyrénées Orientales
Porteur de projet : Juliette Langand
Responsable scientifique IHPE : Juliette Langand
Partenaires : HPNP Tautavel  /  Parc Naturel Régional des Pyrénées Catalanes  / Fédération de chasse 66  / éleveurs agriculteurs, vétérinaires et abattoir de Perpignan

IFREMER Gigas-Cas13 (2023-2024) Génétique inverse chez les bivalves d’intérêt économique via l’approche CRISPR-Cas13 : établissement de la preuve du concept chez l’huître Crassostrea gigas
Coordinateurs / Responsable scientifique : JM Escoubas, C. Montagnani, V. Boulo
Partenaires : IHPE-TREV / IHPE-2MAP

IFREMER DS / GT Huître : TidORSTREA (2020-2025) Zones intertidales et changements d’habitats, plasticités phénotypiques et réponses adaptatives chez les bivalves sessiles en milieu tempéré (Crassostrea) et tropical (Saccostrea)
Porteur de projet : Chin-Long Ky & Yannick Gueguen
Responsable scientifique IHPE : Chin-Long Ky
Partenaires : ASIM / LEMAR Argenton  /  IFREMER Sète  /  IFREMER Tahiti

IFREMER ANTIBIOTHAU (2021-2022) Projet pilote pour évaluer le risque de l’antibiorésistance dans le bassin ostréicole de Thau
Porteur de projet : Caroline Montagnani
Responsable scientifique : Caroline Montagnani
Partenaires : MARBEC Montpellier / SMBT / MIVEGEC

IFREMER AFD : SAAFE (2021-2024) Marqueur d’adaptation et d’acclimatation aux changement globaux et gestion de l’écosystème
Porteur de projet : Jérémie Vidal-Dupiol
Responsable scientifique : Jérémie Vidal-Dupiol
Partenaires : LEAD-NC / RMPF-PF / USP-Fiji

UPVD BQR CALICO (2021-2022) Etudes de génétique des populations de Calicophoron daubneyi, parasite du bétail sur les estives des Pyrénées Orientales
Porteur de projet : Juliette Langand

Régionaux

Région Occitanie/plan littoral Méditerranée Avenir Littoral 2023 : SEAVOLUTION (2023-2025) Mesure d’effets biologiques de techniques d’exploitation innovantes par la surveillance ostréicole in situ en milieu lagunaire
Coordinateur : société Seaducer
Responsable scientifique IHPE : Caroline Montagnani
Partenaires : MARBEC / SEADUCER

Région Nouvelle Aquitaine, Projet de maturation : STAR2 (2023-2025) Stimulation antivirale chez l’huître Crassostrea gigas
Porteur de projet : Caroline Montagnani & Benjamin Morga
Responsable scientifique IHPE : Caroline Montagnani
Partenaires : ASIM La Tremblade

DRM Polynésie : OstreaPOL (2020-2023) Innovation scientifique et technologique pour la relance potentielle d’une filière ostréicole (Saccostrea sp.) en Polynésie française
Porteur de projet : Chin-Long Ky & Christian Monaco
Responsable scientifique IHPE : Chin-Long Ky
Partenaires :  RMPF Tahiti

DRM Polynésie : QUANAPA (2020-2025) Qualité des Nacres et Perles Améliorées : études des interactions donneuse-receveuse-environnement
Porteur de projet : Chin-Long Ky
Responsable scientifique IHPE : Chin-Long Ky
Partenaires :  RMPF Tahiti

Privés

WELLCOME TRUST FOUNDATION : SHIS-CAM (2023-2031) Species hybridisation and interactions in schistosomiasis in Cameroon : Targeting biological research to accelerate disease elimination in Central Africa

PARTENAIRE PRIVE : PinctAdapt (2019-2024) Adapatation et acclimatation transgenerationnel de l’huitre perlière aux changements globaux
Porteur de projet : Jérémy Le Luyer
Responsable scientifique IHPE : Jérémie Vidal-Dupiol
Partenaires : EIO Tahiti  /  Institut FRESNEL Marseille  /  Louis Bernatchez’s Lab, Québec /  CRIOBE Perpignan

EN COURS

Mathilde JAQUET (2024, Dir. Olivier Rey & Thierry Lefèvre –MIVEGEC)
Le microbiote des hôtes intermédiaires escargots et des arthropodes vecteurs de zoonoses sous contraintes génétiques et environnementales : une approche de la capacité vectorielle

Klervi LUGUE (2024, Dir. Jérémie Vidal-Dupiol)

Privat AGNIWO (2025, Dir. Jérôme Boissier & Abdoulaye Dabo, Bénin)
Hybridation entre Schistosoma haematobium (schistosome humain) et S. bovis (schistosome du bétail) chez les humains au Mali (Afrique de l’Ouest) : diagnostic, génétique des populations et importance en santé publique

BUSO Pauline (2026, Dir. Jérémy Vidal-Dupiol & Olivier Rey)
Diversité intraspécifique des coraux dans un monde plus chaud : de la structure spatio-temporelle aux biomarqueurs fonctionnels d’adaptation au stress thermique.

SOUTENUES

• BLIN Manon (2023 Dir. Jérôme Boissier & Julien Portela)
  Développement d’outils de diagnostic de terrain pour la détection de la schistosomiase : une approche One Health
  Manon est responsable R&D chez Paradev
• Philippe DOUCHET (2023 Dir. Jérôme Boissier & Olivier Rey)
  Écologie de la transmission des vers parasites du genre Schistosoma
  Philippe est ingénieur contractuel à IHPE
  
• Cécile BLANCHON (2023 Dir. Christophe Calvayrac, Gael Plantard & Eve Toulza)
  Effet des procédés photo-oxydatifs sur les interactions entre les communautés microbiennes et l’huître creuse Crassostrea gigas
• Janan GAWRA (2022 Dir. Christoph Grunau, Jérémie Vidal-Dupiol & Jean-Baptiste Lamy)
  Approche intégrative des mécanismes de résistance au syndrome de mortalités massives chez les juvéniles d’huître creuse Crassostrea gigas (POMS) (le pdf sur HAL)
  Janan est en post-doctorat à l‘Instituto de Diagnóstico Ambiental y Estudios del Agua – CSIC à Barcelone, Espagne
• Amos ONYEKWERE (2022 Dir. Jérôme Boissier & Olivier Rey)
  Structure génétique des populations et hybridation des parasites responsables de la schistosomiase urogénitale chez les écoliers du primaire au Nigeria (le pdf sur HAL)
  Amos est Lecturer à l’Enugu State University of science and Technology, Nigeria
• Jean DELMOTTE (2021 Dir. Jean-Michel Escoubas & Caroline Montagnani)
  Caractérisation de la diversité et de la dynamique du virome de Crassostrea gigas et analyse de son interaction avec la réponse antivirale de l’huître (le pdf)
  Jean est bioinformaticien chez Sanofi
• Stephen MULERO (2020, Dir. Jérôme Boissier & Olivier Rey)
  MOLRISK, un nouvel outil de diagnostic pour inférer le risque de transmission des maladies infectieuses transmises par les mollusques (le pdf sur HAL)
  Stephen est ingénieur de recherche, responsable de la plateforme eDNA (AnaEE France) du laboratoire d’Ecologie Alpine
• Camille HUOT (2019 Dir. David Duval & Eve Toulza)
  Caractérisation et rôle, dans l’interaction tripartite, du microbiote d’hôtes intermédiaires Planorbidae des parasites trématodes Schistosoma spp., agents responsables de la bilharziose (le pdf sur HAL)
  Camille est enseignante de Sciences de la nature, en collège
• Pierre-Louis STENGER (2019 Dir. Chin Long Ky & Serge Planes)
  Plasticité et diversité chromatique de l’huître perlière Pinctada margaritifera var. cumingii: exploration du triptyque phénome, génome et épigénome.
  Pierre-Louis est en post-doctorat à l’Institut Agronomique Néo-Calédonien IAC
• Julien KINCAID-SMITH (2018 Dir. Jérôme Boissier & Eve Toulza)
  Modification des traits d’histoire de vie au cours de l’hybridation et analyse des mécanismes moléculaires sous-jacents chez les parasites plathelminthes du genre Schistosoma (le pdf sur HAL)
  Après un post-doctorat au Royal Veterinary College de Londres (UK), Julien est maintenant en post-doc au CBGP de Montpellier (2021-2026)
  
• Maxime LAFONT (2017 Dir. Benjamin Gourbal & Caroline Montagnani)
  Mécanismes et spécificité du priming immunitaire antiviral chez un Lophotrochozoaire, l’huître creuse Crassostrea gigas (le pdf sur HAL)
  Maxime est Directeur Technique chez Bioceanor
• Kelly BRENER-RAFFALLI (2017 Dir. Guillaume Mitta & Eve Toulza)
  Dynamique de l’holobionte corallien et plasticité transcriptomique : variabilité interindividuelle, interpopulationnelle et interspécifique (le pdf  sur HAL)
  Kelly est Conseillère Principale d’Education dans l’Education Nationale
• Marion PICARD (2015 Dir. Jérôme Boissier & Céline Cosseau)
  Etude des bases moléculaires du déterminisme sexuel et de la différenciation chez une espèce hétérogamétique femelle ZZ-ZW : Schistosoma mansoni (le pdf sur HAL)
  Marion vient d’être recrutée comme Maître de conférences à l’Université de Perpignan/IHPE, après 3 post-doctorats en France et à l’étranger
• Rodolfo RONDON (2015 Dir. Caroline Montagnani & Céline Cosseau)
  Effets de l’exposition parental au diuron sur le méthylome et transcriptome de l’huître creuse Crassostrea gigas : Impact de fonctions de gènes ciblées par le polluant ?
  Rodolfo est chercheur à l’INACH (Chili)
  

portail HAL de la collection de l’équipe depuis 2021
listing HAL des publications de l’équipe depuis 2021

production des auteurs de l’équipe avant la création de celle-ci :

2020

• Alves Monteiro, H. J., C. Brahmi, A. B. Mayfield, J. Vidal-Dupiol, B. Lapeyre and J. Le Luyer (2020) Molecular mechanisms of acclimatation to long-term elevated temperature exposure in marine symbioses. Global Change Biology 26(3): 1271-1284. DOI 10.1111/gcb.14907 / HAL
• Blanchet, S., J. G. Prunier, I. Paz-Vinas, K. Saint-Pé, O. Rey, A. Raffard, E. Mathieu-Bégné, G. Loot, L. Fourtune and V. Dubut (2020) A river runs through it: The causes, consequences, and management of intraspecific diversity in river networks. Evolutionary Applications 13: 1195-1213. DOI 10.1111/eva.12941 / HAL
• Clerissi C., De Lorgeril J., Petton B., Lucasson A., Escoubas J.M., Gueguen Y., Dégremont L., Mitta G. and Toulza E. (2020) Microbiota composition and evenness predict survival rate of oysters confronted to pacific oyster mortality syndrome. Frontiers in Microbiology 11: 311. DOI 10.3389/fmicb.2020.00311 / HAL
• Clerissi, C., L. Guillou, J. M. Escoubas and E. Toulza (2020) Unveiling protist diversity associated with the Pacific oyster Crassostrea gigas using blocking and excluding primers. BMC Microbiology 20(13). DOI 10.1186/s12866-020-01860-1 / HAL
• De Lorgeril J., Petton B., Lucasson A., Perez V., Stenger P.L., Dégremont L., Montagnani C., Escoubas J.M., Haffner P., Allienne J.F., Leroy M., Lagarde F., Vidal-Dupiol J., Gueguen Y. and Mitta G. (2020) Differential basal expression of immune genes confers Crassostrea gigas resistance to Pacific Oyster Mortality Syndrome. BMC Genomics 21: 63. DOI 10.21203/rs.2.16448/v2 / HAL
• Delmotte J., Chaparro C., Galinier R., De Lorgeril J., Petton B., Stenger P.L., Vidal-Dupiol J., Destoumieux-Garzon D., Gueguen Y., Montagnani C., Escoubas J.M. and Mitta G. (2020) Contribution of viral genomic diversity to oyster susceptibility in the Pacific oyster mortality syndrome. Frontiers in Microbiology 11: 1579. DOI 10.3389/fmicb.2020.01579 / HAL
• Dupont S., Lokmer A., Corre E., Auguet J.-C., Petton. B., Toulza E., Montagnani C., Tanguy G., Pecqueur D., Salmeron C., Guillou L., Desnues C., La Scola B., Bou Khalil J., de Lorgeril J., Mitta G., Gueguen Y. and Escoubas J.-M. (2020) Oyster hemolymph is a complex and dynamic ecosystem hosting bacteria, protists and viruses. Animal Microbiome 2: 12. DOI 10.1186/s42523-020-00032-w / HAL 
• Huot C., Clerissi C., Gourbal B., Galinier R., Duval D. and Toulza E. (2020) Schistosomiasis vector snails and their microbiota display a phylosymbiosis pattern. Frontiers in Microbiology 10: 3092. DOI 10.3389/fmicb.2019.03092 /HAL
• Kebede, T., N. Bech, J. F. Allienne, O. Rey, B. Erko and J. Boissier (2020) Genetic evidence of the role of non-human primates as reservoir host for human schistosomiasis. Plos Neglected Tropical Diseases 14(9): e0008538. DOI 10.1371/journal.pntd.0008538 / HAL
• Lafont M., Vergnes A., Vidal-Dupiol J., De Lorgeril J., Gueguen Y., Haffner P., Petton B., Chaparro C., Barrachina C., Destoumieux-Garzon D., Mitta G., Gourbal B. and Montagnani C. (2020) A sustained mechanism supports long-term immune priming in the pacific oyster Crassostrea gigas. mBIO 11: e02777-02719. DOI 10.1128/mBio.02777-19 / HAL
• Le Govic Y., Gourbal B. and Boissier J. (2020) Booming omics in Schistosoma. Trends in Parasitology online. DOI 10.1016/j.pt.2020.10.010
• Le Moullac, G., C. Soyez, P. Lyonnard, S. Chabrier, L. Milhade, Y. Gueguen and B. Beliaeff (2020) Non-invasive functional exploration techniques for bivalves with applications to pearl oyster Pinctada margaritifera. Reviews in Aquaculture 1-9. DOI 10.1111/raq.12409 / HAL
• Lucasson A., Luo X., Mortaza S., De Lorgeril J., Toulza E., Petton B., Escoubas J.M., Clerissi C., Degremont L., Gueguen Y., Destoumieux-Garzon D., Jacq A., Mitta G. (2020). A core of functionally complementary bacteria colonizes oysters in Pacific Oyster Mortality Syndrome. BIORXIV : 384644 .
• Rey, O., C. Eizaguirre, B. Angers, M. Baltazar-Soares, K. Sagonas, J. G. Prunier and S. Blanchet (2020) Linking epigenetics and biological conservation: towards a conservation epigenetics perspective. Functional Ecology 34 : 414-427. DOI 10.1111/1365-2435.13429 / HAL
• Reyser, T., T. H. To, C. Egwu, L. Paloque, M. Nguyen, A. Hamouy, C. Stigliani, C. Bijani, J. M. Augereau, J. P. Joly, J. Portela, J. Havot, S. R. A. Marque, J. Boissier, A. Robert, F. Benoit-Vical and G. Audran (2020) Alkoxyamines designed as potential drugs against Plasmodium and Schistosoma parasites. Molecules MDPI 25(17): 3838. DOI 10.3390/molecules25173838 / HAL
• The Holomarine working group, S. M. Dittami, E. Arboleda, J.-C. Auguet, A. Bigalke, E. Briand, P. Cardenas, U. Cardini, J. Decelle, A. H. Engelen, D. Eveillard, C. M. M. Gachon, S. M. Griffiths, T. Harder, E. Kayal, E. Kazamia, F. H. Lallier, M. Medina, E. M. Marzinelli, T. Morganti, L. Núñez Pons, S. Prado, J. Pintado Valverde, M. Saha, M. A. Selosse, D. Skillings, W. Stock, S. Sunagawa, E. Toulza, A. Vorobev, C. Leblanc and F. Not (2020) A community perspective on the concept of marine holobionts: current status, challenges, and future directions. Peer J Preprints  7: e27519v3+ Reviewed and recommanded by PCI Ecology (26/02/2020). DOI 10.7287/peerj.preprints.27519v3

• Vidal-Dupiol J., Chaparro C., Pratlong M., Pontarotti P., Grunau C. and Mitta G. (2020) Sequencing, de novo assembly and annotation of the genome of the scleractinian coral, Pocillopora acuta. BIORXIV (698688 du 19 avril 2020)

2019

• Angora, E. K., J. Boissier, H. Menan, O. Rey, K. Tuo, A. O. Touré, J. T. Coulibaly, A. Méité, G. Raso, E. K. N’Goran, J. Utzinger and O. Balmer (2019) Prevalence and risk factors for Schistosomiasis among schoolchildren in two settings of Côte d’Ivoire. Tropical Medicine and Infectious Diseases 4(3): 110. DOI 10.3390/tropicalmed4030110 / HAL
• Angora, K. E., J. F. Allienne, O. Rey, H. Menan, A. O. Touré, J. T. Coulibaly, G. Raso, W. Yavo, E. K. N’Goran, J. Utzinger, O. Balmer and J. Boissier (2019) High prevalence of Schistosoma haematobium x Schistosoma bovis hybrids in schoolchildren in Côte d’Ivoire. Parasitology 147(3): 287 – 294. DOI 10.1017/S0031182019001549
• Bech, N., C. Novoa, J. F. Allienne, J. Boissier and E. Bro (2019) Quantifying genetic distance between wild and captive strains of the grey partridge Perdrix perdrix in France: conservation implications. Biodiversity and Conservation 29: 609-624. DOI 10.1007/s10531-019-01901-w / HAL
• Brahmi, C., L. Chapron, G. Le Moullac, C. Soyez, B. Beliaeff, C. Lazareth, N. Gaertner-Mazouni and J. Vidal-Dupiol (2019) Effect of temperature and pCO2 on the respiration, biomineralization and photophysiology of the giant clam Tridacna maxima. BIORXIV: 672907 (le 18 juin 2019) DOI 10.1101/672907
• Brener-Raffalli, K., J. Vidal-Dupiol, M. Adjeroud, O. Rey, P. Romans, F. Bonhomme, M. Pratlong, A. Haguenauer, R. Pillot, L. Feuillassier, M. Claereboudt, H. Magalon, P. Gélin, P. Pontarotti, D. Aurelle, G. Mitta and E. Toulza (2019) Gene expression plasticity and frontloading promote thermotolerance in Pocilloporid corals. BioRxiv (398602 en 2018) and  Peer reviewed and recommended by PCI Ecology (26 august 2019)
  
• Danchin, E., A. Pocheville, O. Rey, B. Pujol and S. Blanchet (2019) Epigenetically facilitated mutational assimilation : epigenetics as a hub within the inclusive evolutionary synthesis : epigenetics as a hub for genetic assimilation. Biological Reviews 94: 259-282.
  DOI 10.1111/brv.12453 / HAL
• Debeljak, P., E. Toulza, S. Beier, S. Blain and I. Obernosterer (2019) Microbial iron metabolism as revealed by gene expression profiles in contrasted Southern Ocean regimes. Environmental Microbiology 21: 2360-2374. DOI 10.1111/1462-2920.14621 / HAL
• Djuikwo-Teukeng, F. F., A. Kouam Simo, J. F. Allienne, O. Rey, A. Njayou Ngapagna, L. A. Tchuem-Tchuente and J. Boissier (2019) Population genetic structure of Schistosoma bovis in Cameroon. Parasites & Vectors 12(1): 56. DOI 10.1186/s13071-019-3307-0 / HAL
• Guegan, H., J. Fillaux, E. Charpentier, F. Robert-Gangneux, P. Chauvin, E. Guemas, J. Boissier, A. Valentin, S. Cassaing, P. Gangneux, A. Berry and X. Iriart (2019) Real-time PCR for diagnosis of imported schistosomiasis. Plos Neglected Tropical Diseases 13: e0007711 DOI 10.1371/journal.pntd.0007711 / HAL
• Lafont, M., P. Goncalves, X. Guo, C. Montagnani, D. Raftos and T. Green (2019) Transgenerational plasticity and antiviral immunity in the Pacific oyster (Crassostrea gigas) against Ostreid herpesvirus (OsHV-1). Developmental and Comparative Immunology 91: 17-25. DOI 10.1016/j.dci.2018.09.022 / HAL
• Le Govic, Y., J. Kincaid-Smith, J. F. Allienne, O. Rey, L. de Gentile and J. Boissier (2019) Schistosoma haematobium–Schistosoma mansoni Hybrid Parasite in Migrant Boy, France, 2017. Emerging Infectious Diseases 25: 365-367. DOI 10.3201/eid2502.172028 / HAL
• Le Luyer, J., P. Auffrey, V. Quillien, N. Leclerc, C. Reisser, J. Vidal-Dupiol and C. L. Ky (2019) Whole transcriptome sequencing and biomineralizatin gene architecture associated with cultured pearl quality traits in the pearl oyster, Pinctada margarifera. BioRxiv (421545) + BMC Genomics 20: 111. DOI 10.1186/s12864-019-5443-5 /  HAL
• Mathieu-Bégné, E., G. Loot, S. Blanchet, E. Toulza, C. Genthon and O. Rey (2019) De novo transcriptome assembly for Tracheliastes polycolpus, an invasive ectoparasite of freshwater fish in western Europe. Marine Genomics 46: 58-61. DOI  10.1016/j.margen.2018.12.001 / HAL
• Mulero, S., J. Boissier, J. F. Allienne, Y. Quilichini, J. Foata, J. P. Pointier and O. Rey (2019) Environmental DNA for detecting Bulinus truncatus: a new environmental surveillance tool for schistosomiasis emergence risk assessment. Environmental DNA 2(2): 161-174
  DOI 10.1002/edn3.53 / HAL
• Mulero, S., O. Rey, N. Arancibia, S. Mas-Coma and J. Boissier (2019) Persistent establishment of a tropical disease in Europe : the preadaptation of tropical schistosomes to overwinter. Parasites & Vectors 12: 379. DOI 10.1186/s13071-019-3635-0 / HAL
• Oleaga, A., O. Rey, B. Polack, S. Grech-Angelini, Y. Quilichini, R. Pérez-Sanchez, P. Boireau, S. Mulero, A. Brunet, A. Rognon, I. Vallée, J. Kincaid-Smith, J. F. Allienne and J. Boissier (2019) Epidemiological surveillance of schistosomiasis outbreak in Corsica (France): Are animal reservoirs hosts implicated in local transmission? Plos Neglected Tropical Diseases 13(6): e0007543. DOI 10.1371/journal.pntd.0007543 / HAL
• Picard, M. A. L., B. Vicoso, D. Roquis, I. Bulla, R. De Carvalho Augusto, N. Arancibia, C. Grunau, J. Boissier and C. Cosseau (2019) Dosage compensation throughout the Schistosoma mansoni lifecycle: specific chromatin landscape of the Z chromosome. Genome Biology and Evolution 11(7): 1909-1922. DOI 10.1093/gbe/evz133 / HAL
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