Equipe TReV : Transmission, Résistance et Virulence

Etude de la virulence des pathogènes et la résistance des hôtes afin d’appréhender la dynamique de transmission des pathogènes dans divers pathosystèmes aquatiques

poster de présentation de l’équipe

Les interactions hôtes – pathogènes entraînent des changements phénotypiques rapides et réciproques sur des échelles de temps observables, couramment appelés la course aux armements. Les modifications de phénotypes des hôtes et des agents pathogènes sont également liées à l’histoire de vie des agents pathogènes et des hôtes, sur des échelles de temps qui dépassent le cycle de vie de chaque partenaire, comme les effets transgénérationnels. Ainsi, le succès de la transmission des agents pathogènes dépend de multiples facteurs influençant la virulence des agents pathogènes et la résistance des hôtes, et ces éléments clés sont conditionnés par des contraintes environnementales, notamment les interactions biotiques et abiotiques et l’écologie de l’hôte. Nos objectifs sont d’étudier comment les modifications des caractéristiques des agents pathogènes et des hôtes, au fil du temps, entraînent des changements dans leur façon d’interagir avec des conséquences directes sur la transmission et la persistance de la maladie.

Pour étudier des systèmes aussi dynamiques, nous travaillons avec des populations naturelles dans lesquelles la plasticité et/ou la microévolution sont toujours en cours, mais où leurs modalités d’interaction sont simplifiées pour des raisons opérationnelles pour se prêter à des investigations expérimentales.Nous travaillons avec différents pathosystèmes qui couvrent un large éventail d’interactions en milieux aquatiques, ces interactions s’étendent des parasites obligatoires aux interactions opportunistes. Nos modèles d’étude sont par exemple : les maladies polymicrobiennes chez les huîtres (le syndrome de mortalité des huîtres du Pacifique, POMS), les maladies liées aux néoplasies chez les moules, ainsi que la schistosomiase. Notre équipe est composée  de 9 chercheurs aux compétences complémentaires qui nous permettent de mener des projets de recherche interdisciplinaires et intégratifs.


Responsables :
CHARRIERE Guillaume, Professeur, Univ. Montpellier
COSSEAU Céline, Professeure, Univ. Perpignan

Personnel permanent :
DESTOUMIEUX-GARZON Delphine, Directrice de Recherche CNRS
ESCOUBAS Jean-Michel, Chargé de Recherche CNRS
LAGORCE Arnaud, Maître de conférences Univ. Perpignan
MONE Hélène, Directrice de Recherche CNRS
MOUAHID Gabriel, Maître de conférences Univ. Montpellier
TRAVERS Marie-Agnès, Chargée de Recherche 2A Ifremer

Personnel non permanent :
MOUGIN Julia, Post-doctorante Ifremer
HERNANDEZ CABANYERO Carla, Post-doctorante Marie curie/Ifremer

BOUCHEREAU Elyna, Doctorante Univ. Perpignan
DELLONG Amélie, Doctorante Univ. Perpignan
DUPERRET Léo, Doctorant Univ. Perpignan
MAROT Agathe, Doctorante CNRS
ONILLON Laura, Doctorante Univ. Montpellier
REGGIARDO Bérénice, Doctorante Univ. Montpellier

Personnel parti dernièrement :
DANTAN Luc, Doctorant Univ. Perpignan
DE SAN NICOLAS Noémie, Doctorante CNRS
SAAD Jamal, Post-Doctorant CNRS

En cliquant sur la punaise vous obtiendrez le nom et l’URL du partenaire.


Internationaux

Financement Européen : BIOPOLIS (2020- )
Porteur de projet : Pierre Boursot
Responsable scientifique : Céline Cosseau & Christoph Grunau
Partenaires : CIBIO-InBio Porto

Fonds Européen pour les Affaires Maritimes et la Pêche : GESTINNOV (2021-2023) Soutien de stock et repeuplement de l’Ormeau en zone littoral bretonne et normande
Porteur de projet : Jérémie Vidal-Dupiol
Responsable scientifique : Jérémie Vidal-Dupiol
Partenaires : Etablissements Papin / Etablissements MediThau / RMPF

Financement Européen : SPARE-SEA (2021-2024) Environmental Spread and Persistence of Antibiotic REsistance in aquatic systems Exposed to oyster Aquaculture
Porteur de projet : Mathias Wegner
Responsable scientifique : Delphine Destoumieux-Garzon
Partenaires :  AWI Allemagne / CNR Italie / UNIGE Italie / IRTA Espagne

Financement Européen : HYPERCAN (2023-2028) Mechanisms and evolutionary significance of HYPERploidy variations in a long-lived parasitic CANcer
Porteur de projet : Erika Burioli
Responsable scientifique : Erika Burioli

ANR Internationale : EPIMUTATOR (2021-2024)
Porteur de projet : Fernanda Janku Cabral
Responsable scientifique : Céline Cosseau & Christoph Grunau
Partenaires : Université de Campinas

Nationaux

ANR : TEATIME (2022-2026) TEmporal dynAmics, evoluTIon and Mechanisms of transgEnerational plasticity in a prey-predator context
Porteur de projet : Emilien Lucquet
Responsable scientifique IHPE : Céline Cosseau & Christoph Grunau
Partenaires : LEHNA  Lyon

ANR : DECICOMP (2019-2024) Deciphering the whole complexity of the Pacific Oyster Mortality Syndrome for modeling epidemiological risk
Porteur de projet : Guillaume Mitta
Responsable scientifique IHPE :
Partenaires : LEMAR Brest / ASIM / PFOM Plouzané/ LBI2M Roscoff/ MIVEGEC Montpellier

ANR : MOSAR-Def (2020-2024) How to modulate the salt-stability of antimicrobial defensins
Porteur de projet : Agnès Delmas
Responsable scientifique IHPE : Delphine Destoumieux-Garzon
Partenaires : CBM Orléans  /  Pasteur Paris   / UGA Grenoble / LIAA Brésil

ANR : PRIMOYSTER (2023-2026) Characterization of innate immune PRIMing mechanisms applied to OYSTER protection against the Pacific Oyster Mortality Syndrome
Porteur de projet : Caroline Montagnani
Responsable scientifique : Céline Cosseau & Christoph Grunau

ANR : FRIDA (2023-2027) Fast Regenerated Inbreeding Depression in Animals
Porteur de projet : Patrice David
Responsable scientifique : Céline Cosseau & Christoph Grunau
Partenaires : CEFE Montpellier

ANR : ORMER (2024-2027) Preserving and enhancing the ORMER populations: a key component in the socio-ecosystem of western France coastal fisheries
Porteur de projet : Sabine Roussel
Responsable scientifique : Marie-Agnès Travers
Partenaires :LEMAR Brest, AMURE, France Haliotis, Parc Naturel Iroise

Appel à Projet pour l’Afrique : SchistoVarHyb (2022-2023) Approche exploratoire suite à la découverte de variants hybrides de schistosomes partagés par l’Homme et les Mammfières qui vivent dans son environnement
Porteur de projet : Hélène Moné & Ibikounlé Moudachirou
Responsable scientifique : Gabriel Mouahid & Hélène Moné
Partenaires : Nogoshi Memorial Institute for medical research University of Ghana / Université Abomey Calavi Benin / UMR MERIT

Institutionnels

IFREMER : Giga-Cas13 (2024) Génétique inverse chez les bivalves d’intérêt économique via l’approche CRISPR-Cas13 : établissement de la preuve du concept chez l’huître Crassostrea gigas
Porteur de projet : Jean-Michel Escoubas & Caroline Montagnani
Responsable scientifique IHPE : Jean-Michel Escoubas

UPVD, BQR EpiPatho (2023)Etude des régulations EPIgénétiques chez la bactérie PATHOgène des huîtres Vibrio aestuarianus
Porteur de projet : Arnaud Lagorce
Responsable scientifique IHPE : Arnaud Lagorce & Marie-Agnès Travers

Labex TULIP  : EpiVib (2023-2024) Deciphering epigenetic and transcriptomic regulations in the oyster pathogen V. aestuarianus
Porteur de projet : Arnaud Lagorce & Marie-Agnès Travers
Responsable scientifique IHPE : Arnaud Lagorce & Marie-Agnès Travers

MUSE KIM Sea & Coast : VINSEQ (2021-2022) Investigating coincidental selection of virulence traits in Vibrios using an INseq approach
Porteur de projet : Guillaume Charrière
Responsable scientifique IHPE : Guillaume Charrière
Partenaires : Mandel’s Lab, Univ Wisconsin USA

MUSE : BLUECANCER (2019-2022) Biologie cellulaire et évolutive du cancer transmissible de la moule bleue
Porteur de projet : Guillaume Charrière & Nicolas Bierne
Responsable scientifique IHPE : Guillaume Charrière
Partenaires : ISEM Montpellier


EN COURS

Léo DUPERRET (en 2024 Dir. Arnaud Lagorce & Christoph Grunau)
Étude intégrative de la permissivité au syndrome de mortalité des huîtres juvéniles (POMS) : quelles sont les modifications fonctionnelles des assemblages bactériens associés aux huîtres sous différentes conditions de permissivité à la maladie ?

Laura ONILLON (en 2024 Dir. Marie-Agnès Travers & Guillaume Charrière)
Étude du rôle des interactions amibes – vibrios en milieu marin dans l’émergence des pathogènes

DELLONG Amélie (en 2025, Dir. Céline Cosseau & Christoph Grunau)
Structures chromatiniennes et réponse environnementale chez Crassostrea gigas (huître creuse)

Elyna BOUCHEREAU (en 2026, Dir. Arnaud Lagorce & Marie-Agnès Travers)
ENVIR : Impact des facteurs ENvironnementaux sur la VIbriose de l’huître : Régulations transcriptomiques et épigénétiques

REGGIARDO Bérénice (en 2026, Dir. Delphine Destoumieux-Garzon & Viviane Boulo)
Ecologie et évolution de l’antibiorésistance en milieu lagunaire méditerranéen.

SOUTENUES

  • Noémie DE SAN NICOLAS (2023 Dir. Delphine Destoumieux-Garzon, Caroline Montagnani & Philippe Bulet)
    Diversité fonctionnelle et mécanisme d’action des Big défensines, peptides antimicrobiens de l’huître Crassostrea gigas
  • Luc DANTAN (2023 Dir. Céline Cosseau, Eve Toulza & Yannick Gueguen)
    Caractérisation des effets bénéfiques de la microflore naturelle de l’huître du Pacifique Crassostrea gigas en vue d’applications en conchyliculture
  • Aurélie MESNIL (2022 Dir. Marie-Agnès Travers)
    Émergence, dynamique évolutive et écologie de lignées pathogènes de bivalves marins au sein de l’espèce bactérienne Vibrio aestuarianus (le pdf sur HAL)
    Aurélie est en post-doctorat à INRAE « Génétique Quantitative et Evolution » Le Moulon
  • Chrystelle LASICA (2022 Dir. Hélène Moné & Cristian Chaparro)
    Emission rythmique des cercaires de Schistosoma mansoni : du phénotype au(x) gène(s). (le pdf sur HAL)
    Chrystelle est Ingénieure contractuelle à l’ISEM
  • Maurine HAMMEL (2021 Dir. Guillaume Charrière & Nicolas Bierne)
    Biologie, écologie et évolution du cancer transmissible MtrBTN2 des moules Mytilus sp. (le pdf)
    Maurine est en post-doctorat à l’Université de Cambridge, UK
  • Jean DELMOTTE (2021 Dir. Jean-Michel Escoubas & Caroline Montagnani)
    Caractérisation de la diversité et de la dynamique du virome de Crassostrea gigas et analyse de son interaction avec la réponse antivirale de l’huître (le pdf).
    Jean est bioinformaticien chez Sanofi
  • Caïré BARRETO (2021 Dir.  Raphael Diego Da Rosa & Delphine Destoumieux-Garzon)
    Caractérisation moléculaire, transcriptionnelle et fonctionnelle des crustines chez les crevettes Litopenaeus vannamei
    Caïré est en post-doctorat au laboratoire GeorgeDimopoulous de la Johns Hopkings University, USA
  • Nelia LUVIANO (2021 Dir. Christoph Grunau & Céline Cosseau)
    La méthylation de l’ADN chez Biomphalaria glabrata, rôle et impact sur la transmission de la bilharziose (le pdf sur HAL)
    Nelia est en post-doctorat à IHPE
  • Boris SAVASSI (2020 Dir. Hélène Moné & Moudachirou Ibikounle)
    Interactions entre schistosoma haematobium et schistosoma bovis chez l’homme dans les zones lacustres du sud-bénin : Rôle du bétail domestique et des rongeurs dans la transmission (le pdf)
    Boris est en post-doctorat MOPGA à l’IHPE
  • Daniel OYANEDEL-TRIGO (2020 Dir. Delphine Destoumieux-Garzon & Guillaume Charrière) (le pdf)
    Bases moléculaires et cellulaires des interactions Vibrios/Crassostrea gigas en contexte sain et pathologique.
    Daniel est en post-doctorat à Pontificia Universidad Católica de Valparaíso au Chili
  • Manon FALLET (2019 Dir. Christoph Grunau & Céline Cosseau)
    Etude de la réponse environnementale et transgénérationelle chez l’huître creuse Crassostrea gigas. Focus sur les mécanismes épigénétiques (le pdf sur HAL)
    Manon est en post-doctorat à l’Université d’Oxford, après un post-doctorat au Man Technology Environment Research Centre de Örebro en Suède
  • Etienne ROBINO (2019 Dir. Guillaume Charrière)
    Etude des amibes marines et de leurs interactions avec les vibrios pathogènes d’huîtres (le pdf sur HAL)
    Etienne est en post-doctorat à VIB (Bruxelles) après un post-doctorat à Vrije Universiteit Amsterdam (Pays-Bas)
  • Tristan RUBIO (2017 Dir. Delphine Destoumieux-Garzon & Guillaume Charrière)
    Diversité des mécanismes d’interactions des vibrios du clade Splendidus et de leur hôte, l’huître creuse Crassostrea gigas (le pdf sur HAL)
    Tristan est en post-doctorat à l’Université de Bruxelles après un post doctorat à l’IBCP
  • Marion PICARD (2015 Dir. Jérôme Boissier & Céline Cosseau)
    Etude des bases moléculaires du déterminisme sexuel et de la différenciation chez une espèce hétérogamétique femelle ZZ-ZW : Schistosoma mansoni (le pdf sur HAL)
    Marion vient d’être recrutée comme Maître de conférences à l’Université de Perpignan/IHPE, après 3 post-doctorats en France et à l’étranger
  • David ROQUIS (2015 Dir. Christoph Grunau & Céline Cosseau)
    Contribution de l’épigénétique dans les  Dauermodifikations et l’évolution adaptative chez le  parasite humain Schistosoma mansoni et le corail  tropical Pocillopora damicornis (le pdf sur HAL)
    David effectue son 3e post-doctorat, à Agroscope (Suisse)
  • Rodolfo RONDON (2015 Dir. Caroline Montagnani & Céline Cosseau)
    Effets de l’exposition parental au diuron sur le méthylome et transcriptome de l’huître creuse Crassostrea gigas : Impact de fonctions de gènes ciblées par le polluant ?
    Rodolfo est chercheur à l’INACH (Chili)
  • Aurore POIRIER (2015 Dir. Delphine Destoumieux-Garzon & Guillaume Charrière)
    Étude comparative des interactions Vibrio-phagocytes dans l’environnement marin (le pdf sur HAL)
    Aurore est Chercheuse à l’Université du Surrey (UK)

portail HAL de la collection de l’équipe depuis 2021
listing HAL des publications de l’équipe depuis 2021
production des auteurs de l’équipe avant la création de celle-ci :

2022

  • Destoumieux-Garzon, D., E. F. Matthies-Wiesler, N. Bierne, A. Binot, J. Boissier, A. Devouge, J. Garric, K. Gruetzmacher, C. Grunau, J. F. Guégan, S. Hurtrez-Boussès, A. Huss, S. Morand, C. Palmer, D. Sarigiannis, R. Vermeulen and R. Barouki (2022). Getting out of crises: Environmental, social-ecological and evolutionary research is needed to avoid future risks of pandemics. Environment International 158: 106915. DOI 10.1016/j.envint.2021.106915 / HAL
  • Fallet, M., Montagnani, C., Petton, B., De Lorgeril, J., Comarmond, S., Chaparro, C., Toulza, E., Boitard, S., Escoubas, J.M., Vergnes, A., Le Grand, J., Bulla, I., Gueguen, Y., Vidal-Dupiol, J., Grunau, C., Mitta, G., Cosseau, C. (2022). Early life microbial exposures shape the Crassostrea gigas immune system for lifelong and intergenerational disease protection. Research Square, Feb22 DOI / HAL
  • Hammel, M., A. Simon, C. Arbiol, A. Villalba, E. A. V. Burioli, J. F. Pepin, J. B. Lamy, A. Benabdelmouna, I. Bernard, M. Houssin, G. Charrière, D. Destoumieux-Garzon, J. J. Welch, M. J. Metzger and N. Bierne (2022). Prevalence and polymorphism of a mussel transmissible cancer in Europe. Molecular Ecology 31(3): 736-751. DOI 10.1111/mec.16052 / HAL
  • Luviano, N., D. Duval, W. Ittiprasert, J. F. Allienne, G. Tavernier, C. Chaparro, C. Cosseau and C. Grunau (2022). Hit-and-run epigenetic editing for vectors of snail-borne parasitic diseases. Frontiers in Cell and Developmental Biology. DOI 10.3389/fcell.2022.794650 / HAL

2021

  • Alpha-Bazin, B., A. Gorlas, A. Lagorce, D. Joulié, J. B. Boyer, M. Dutertre, J. C. Gaillard, A. Lopes, Y. Zivanovic, A. Dedieu, F. Confalonieri and J. Armengaud (2021) Lysine-specific acetylated proteome from the archaeon Thermococcus gammatolerans reveals the presence of acetylated histones. Journal of Proteomics 232: 104044. DOI 10.1016/j.jprot.2020.104044 / HAL
  • Barouki, R., M. Kogevinas, K. Audouze, K. Belesova, A. Bergman, L. Birnbaum, S. Boekhold, S. Denys, C. Desseille, E. Drakvik, H. Frumkin, J. Garric, D. Destoumieux-Garzon, A. Haines, A. Huss, G. Jensen, S. Karakitsios, J. Klanova, L. M. Koskela, F. Laden, F. Marano, E. F. Matthies-Wiesler, G. Morris, J. Nowacki, R. Paloniemi, N. Pearce, A. Peters, A. Rekola, D. Sarigiannis, K. Sebkova, R. Slama, B. Staatsen, C. Tonne, R. Vermeulen, P. Vieneis The HERA-COVID-19 working group (2021) The COVID-19 pandemic and global environmental change: Emerging research needs. Environment International 146: 106272. DOI 10.1016/j.envint.2020.106272 / HAL
  • Burioli, E., M. Hammel, N. Bierne, F. Thomas, M. Houssin, D. Destoumieux-Garzon and G. Charrière (2021). Traits of a mussel transmissible cancer are reminiscent of a parasitic life style. Scientific Reports 11: 24110. DOI 10.1038/s41598-021-03598-w/ HAL
  • De Carvalho Augusto, R., O. Rey, C. Cosseau, C. Chaparro, J. Vidal-Dupiol, J. F. Allienne, D. Duval, S. Pinaud, S. Tönges, R. Andriantsoa, E. Luquet, F. Aubret, M. Dia Sow, P. David, V. Thomson, D. Joly, M. Gomes Lima, D. Federico, E. Danchin, A. Minoda and C. Grunau (2021) A simple ATAC-seq protocol for population epigenetics [version 2; peer review: 1 approved with reservations]. Wellcome Open Research 5: 121. DOI 10.12688/wellcomeopenres.15552.2 / HAL
  • Degremont, L., B. Morga, E. Maurouard and M. A. Travers (2021). Susceptibility variation to the main pathogens of Crassostrea gigas at the larval, spat and juvenile stages using unselected and selected oysters to OsHV-1 and/or V. aestuarianus. Journal of Invertebrate Pathology 183: 107601. DOI 10.1016/j.jip.2021.107601 / HAL
  • Destoumieux-Garzon, D., P. Bonnet, C. Teplitsky, F. Criscuolo, P. Y. Henry, D. Mazurais, P. Prunet, G. Salvat, P. Usseglio-Polatera, E. Verrier and N. Friggens (2021) Animal board invited review: OneARK: Strengthening the links between animal production science and animal ecology. Animal (the International Journal of Animal Biosciences) 15:100053. DOI 10.1016/j.animal.2020.100053 / HAL + recommanded PCI Animal Science 15(1): 100053.

  • Dujon, A., J. S. Brown, D. Destoumieux-Garzon, M. Vittecoq, R. Hamede, A. Tasiemski, J. Boutry, S. Tissot, C. Alix-Panabieres, P. Pujol, F. Renaud, F. Simard, B. Roche, B. Ujvari and F. Thomas (2021). On the need for integrating cancer into the One Health perspective. Evolutionary Applications 14(11): 2571-2575. DOI 10.1111/eva.13303/ HAL
  • Garcia, C., A. Mesnil, D. Tourbiez, M. Moussa, C. Dubreuil, A. Gonçalves de Sa, B. Chollet, Y. Godfrin, L. Dégremont, D. Serpin and M. A. Travers (2021) Vibrio aestuarianus subsp. cardii subsp. nov. pathogenic to the edible cockles, Cerastoderma edule in France, and establishment of Vibrio aestuarianus subsp. aestuarianus subsp. nov. and Vibrio aestuarianus subsp. francensis subsp. nov. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 71(2). DOI 10.1099/ijsem.0.004654 / HAL
  • Le Clec’h, W., F. D. Chevalier, A. C. A. Mattos, A. Strickland, R. Diaz, M. McDew-White, C. M. Rohr, S. Kinung’hi, F. Allan, B. L. Webster, J. P. Webster, A. M. Emery, D. Rollinson, A. G. Djirmay, K. M. Al Mashikhi, S. Al Yafae, M. A. Idris, H. Moné, G. Mouahid, P. LoVerde, J. S. Marchant and T. J. C. Anderson (2021). Genetic analysis of praziquantel resistance in schistosome parasites implicates a Transient Receptor Potential channel. Science Translational Medicine 13(625): eabj9114. DOI 10.1126/scitranslmed.abj9114/ HAL
  • Kincaid-Smith, J., E. Mathieu-Bégné, C. Chaparro, M. Reguera-Gomez, S. Mullero, J. F. Allienne, E. Toulza and B. Boissier (2021). No pre-zygotic isolation mechanisms between Schistosoma haematobium and Schistosoma bovis parasites: from mating interactions to differential gene expression. PLOS Neglected Tropical Diseases 15: e0009363. DOI 10.1371/journal.pntd.0009363 / HAL
  • Kincaid-Smith, J., A. Tracey, R. Augusto de Carvalho, I. Bulla, N. Holroyd, A. Rognon, O. Rey, C. Chaparro, A. Oleaga, S. Mas-Coma, J. F. Allienne, C. Grunau, M. Berriman, J. Boissier and E. Toulza (2021). Morphological and genomic characterisation of the Schistosoma hybrid infecting humans In Europe reveals admixture between Schistosoma haematobium and Schistosoma bovis. PLOS Neglected Tropical Diseases 15: e0010062. DOI 10.1371/journal.pntd.0010062 / HAL
  • Luviano, N., M. Lopez, F. Gawehns, C. Chaparro, P. B. Arimondo, S. Ivanovic, P. David, K. Verhoeven, C. Cosseau and C. Grunau (2021). The methylome of Biomphalaria glabrata and other mollusks: enduring modification of epigenetic landscape and phenotypic traits by a new DNA methylation inhibitor. Epigenetics & Chromatin 14: 48. DOI 10.1186/s13072-021-00422-7/ HAL
  • Moussa, M., E. Cauvin, A. Le Piouffle, O. Lucas, A. Bidault, C. Paillard, F. Benoit, B. Thuillier, M. Treilles, M.-A. Travers and C. Garcia (2021 in press) A MALDI-TOF MS database for fast identification of Vibrio spp. potentially pathogenic to marine mollusks. Applied Microbiology and Biotechnology. DOI 10.1007/s00253-021-11141-0 / HAL
  • Petton, B., D. Destoumieux-Garzόn, F. Pernet, E. Toulza, J. De Lorgeril, L. Degremont and G. Mitta (2021) The Pacific Oyster Mortality Syndrome, a polymicrobial and multifactorial disease: state of knowledge and future directions. Frontiers in Immunology 12: 630343. DOI 10.3389/fimmu.2021.630343 / HAL
  • Pinaud, S., G. Tetreau, P. Poteaux, R. Galinier, C. Chaparro, D. Lassalle, E. Simphor, B. Gourbal and D. Duval (2021 Provisionally accepted) New insights into biomphalysin gene family diversification in the vector snail Biomphalaria glabrata. Frontiers in Immunology. DOI 10.3389/fimmu.2021.635131 / HAL
  • Réveillon, D., V. Savar, E. Schaefer, J. Chevé, M.-P. Halm-Lemeille, D. Hervio-Heath, M. A. Travers, E. Abadie, J.-L. Rolland and P. Hess (2021). Tetrodotoxins in French bivalve mollusks – analytical methodology, environmental dynamics and screening of bacterial strain collections. Toxins 13(11): 740. DOI 10.3390/toxins13110740/ HAL
  • Rey, O., E. Toulza, C. Chaparro, J. F. Allienne, J. Kincaid-Smith, E. Mathieu-Bégné, F. Allan, D. Rollinson, B. L. Webster and J. Boissier (2021) Diverging patterns of introgression from Schistosoma bovis across S. haematobium African lineages. Plos Pathogens 17: e1009313. DOI 10.1371/journal.ppat.1009313 / HAL
  • Savassi, B. A. E. S., G. Dobigny, J. R. Etougbétché, T. T. Avocegan, F. T. Quinsou, P. Gauthier, M. Ibikounlé, H. Moné and G. Mouahid (2021 in press) Mastomys natalensis (Smith, 1834) as a natural host for Schistosoma haematobium (Bilharz, 1852) Weinland, 1858 x Schistosoma bovis Sonsino, 1876 introgressive hybrids. Parasitology Research 120: 1755-1770. DOI 10.1007/s00436-021-07099-7 / HAL
  • Sow, M. D., A. L. Le Gac, R. Fichot, S. Lanciano, A. Delaunay, I. Le Jan, M. C. Lesage-Descause, S. Citerne, J. Caius, V. Brunaud, L. Soubigou-Taconnat, H. Cochard, V. Segura, C. Chaparro, C. Grunau, C. Daviaud, J. Tost, F. Brignolas, S. Strauss, M. Mirouze and S. Maury (2021). RNAi suppression of DNA methylation affects drought stress response and genome integrity in transgenic poplar. New Phytologist 232(1): 80-97. DOI 10.1111/nph.17555 / HAL
  • Stitz, M., C. Chaparro, Z. Lu, V. J. Olzog, C. E. Weinberg, J. Blom, A. Goesmann, C. Grunau and C. G. Grevelding (2021). Satellite-like W Elements: repetitive, transcribed, and putative mobile genetic factors with potential roles for biology and evolution of Schistosoma mansoni. Genome Biology and Evolution 13: evab204. DOI 10.1093/gbe/evab204 / HAL
  • Stenger, P. L., C. L. Ky, C. Reisser, C. Cosseau, C. Grunau, M. Mege, S. Planes and J. Vidal-Dupiol (2021) Environmentally driver color variation in the pearl oster Pinctada margaritifera var. cumingii (Linnaeus, 1758) is associated with differential methylation of CpGs in pigment- and biomineralization-related genes. Frontiers in Genetics 12: 630290. DOI 10.3389/fgene.2021.630290 / HAL

2020

  • Baker-Austin C., Pruzzo C., Oliver J.D., Destoumieux-Garzon D. (2020) Vibrios – from genes to ecosystems. Environmental Microbiology22 : 4093-4095. DOI 10.1111/1462-2920.15229 / HAL
  • Barouki, R., M. Kogevinas, K. Audouze, K. Belesova, A. Bergman, L. Birnbaum, S. Boekhold, S. Denys, C. Desseille, E. Drakvik, H. Frumkin, J. Garric, D. Destoumieux-Garzón, A. Haines, A. Huss, G. Jensen, S. Karakitsios, J. Klanova, I. M. Koskela, F. Laden and t. H.-C.-w. group (2020) The COVID-19 pandemic and global environmental change: Emerging research needs. Environment international 146: 10672. DOI 10.1016/j.envint.2020.106272 / HAL
  • Clerissi C., De Lorgeril J., Petton B., Lucasson A., Escoubas J.M., Gueguen Y., Dégremont L., Mitta G. and Toulza E. (2020) Microbiota composition and evenness predict survival rate of oysters confronted to pacific oyster mortality syndrome. Frontiers in Microbiology 11: 311. DOI 10.3389/fmicb.2020.00311 / HAL
  • Clerissi, C., L. Guillou, J. M. Escoubas and E. Toulza (2020) Unveiling protist diversity associated with the Pacific oyster Crassostrea gigas using blocking and excluding primers. BMC Microbiology 20(13). DOI 10.1186/s12866-020-01860-1 / HAL
  • De Lorgeril J., Petton B., Lucasson A., Perez V., Stenger P.L., Dégremont L., Montagnani C., Escoubas J.M., Haffner P., Allienne J.F., Leroy M., Lagarde F., Vidal-Dupiol J., Gueguen Y. and Mitta G. (2020) Differential basal expression of immune genes confers Crassostrea gigas resistance to Pacific Oyster Mortality Syndrome. BMC Genomics 21: 63. DOI 10.21203/rs.2.16448/v2 / HAL
  • Dégremont, L., P. Azema, E. Maurouard and M.-A. Travers (2020) Enhancing resistance to Vibrio aestuarianus in Crassostrea gigas by selection. Aquaculture 526: 10. DOI 10.1016/j.aquaculture.2020.735429 / HAL
  • Delmotte J., Chaparro C., Galinier R., De Lorgeril J., Petton B., Stenger P.L., Vidal-Dupiol J., Destoumieux-Garzon D., Gueguen Y., Montagnani C., Escoubas J.M. and Mitta G. (2020) Contribution of viral genomic diversity to oyster susceptibility in the Pacific oyster mortality syndrome. Frontiers in Microbiology 11: 1579. DOI 10.3389/fmicb.2020.01579 / HAL
  • Desriac F., El Harras A., Simon M., Bondon A., Brillet B., Le Chevalier P., Pugnière M., Got P., Destoumieux-Garzon D., Fleury Y. (2020) Alterins produced by oyster-associated Pseudoalteromonas are antibacterial cyclolipopeptides with LPS-binding activity. Marine Drugs18 : 630. DOI 10.3390/md18120630 / HAL
  • Destoumieux-Garzon, D., L. Canesi, D. Oyanedel, M.-A. Travers, G. Charrière, C. Pruzzo and L. Vezzuli (2020). Vibrio-bivalve interactions in health and disease. Environmental Microbiology 22: 4323-4341. DOI 10.1111/1462-2920.15055 / HAL
  • Dugé de Bernonville, T., Maury, S., Delaunay, A., Daviaud, C., Chaparro, C., Tost, J., O’Connor, S.E.; Courdavault, V. (2020). Developmental Methylome of the Medicinal Plant Catharanthus roseus Unravels the Tissue-Specific Control of the Monoterpene Indole Alkaloid Pathway by DNA Methylation. International Journal of Molecular Sciences 21: 6028. DOI 10.3390/ijms21176028 / HAL
  • Dupont S., Lokmer A., Corre E., Auguet J.-C., Petton. B., Toulza E., Montagnani C., Tanguy G., Pecqueur D., Salmeron C., Guillou L., Desnues C., La Scola B., Bou Khalil J., de Lorgeril J., Mitta G., Gueguen Y. and Escoubas J.-M. (2020) Oyster hemolymph is a complex and dynamic ecosystem hosting bacteria, protists and viruses. Animal Microbiome 2: 12. DOI 10.1186/s42523-020-00032-w / HAL
  • Gerdol, M., P. Schmitt, P. Venier, G. Rocha, R. Diego Rosa and D. Destoumieux-Garzon (2020). Functional insights from the evolutionary diversification of big defensins. Frontiers in Immunology 11: 758. DOI 10.3389/fimmu.2020.00758 / HAL
  • Lafont M., Vergnes A., Vidal-Dupiol J., De Lorgeril J., Gueguen Y., Haffner P., Petton B., Chaparro C., Barrachina C., Destoumieux-Garzon D., Mitta G., Gourbal B. and Montagnani C. (2020) A sustained mechanism supports long-term immune priming in the pacific oyster Crassostrea gigas. mBIO 11: e02777-02719. DOI 10.1128/mBio.02777-19 / HAL
  • Lucasson A., Luo X., Mortaza S., De Lorgeril J., Toulza E., Petton B., Escoubas J.M., Clerissi C., Degremont L., Gueguen Y., Destoumieux-Garzon D., Jacq A., Mitta G. (2020). A core of functionally complementary bacteria colonizes oysters in Pacific Oyster Mortality Syndrome. BIORXIV : 384644 .
  • Mougin, J., R. Roquigny, M.-A. Travers, T. Grard, M. Bonnin-Jusserand and C. Le Bris (2020). Development of a mreB-targeted real-time PCR method for the quantitative detection of Vibrio harveyi in seawater and biofilm from aquaculture systems. Aquaculture 525: 735337. DOI 10.1016/j.aquaculture.2020.735337 / HAL
  • Oyanedel, D., Y. Labreuche, M. Brutto, H. Amraoui, E. Robino, P. Haffner, T. Rubio, G. M. Charrière, F. Le Roux and D. Destoumieux-Garzon (2020) Vibrio splendidus O-antigen structure: A trade-offbetween virulence to oysters and esistance to grazers. Environmental Microbiology 22(10): 4264-4278. DOI 10.1111/1462-2920.14996 / HAL
  • Savassi, B. A. E. S., G. Mouahid, C. Lasica, S. D. K. Mahaman, A. Garcia, D. Courtin, J. F. Allienne, M. Ibikounle and H. Moné (2020) Cattle as natural host for Schistosoma haematobium (Bilharz, 1852) Weinland, 1858 x Schistosoma bovis Sonsino, 1876 interactions, with new cercarial emergence and genetic patterns. Parasitology Research 119: 2189-2205. DOI 10.1007/s00436-020-06709-0 / HAL

2019

  • Alba, A., Tétreau, G., Chaparro, C., Sanchez, J., Vazquez, A.A., Gourbal, B. (2019). Natural resistance to Fasciola hepatica (Trematoda) in Pseudosuccinea columella snails: A review from literature and insights from comparative “omic” analyses. Developmental and Comparative Immunology 101: 103463. DOI 10.1016/j.dci.2019.103463
  • Ali Birmani, N., S. Naz and G. Mouahid (2019). First Record of Echinoparyphium Recurvatum (Trematoda, Echinostomatidae) in Pakistan with New Avian Definitive Host, Vanellus Leucurus. Arxiv.org 1903.04795 (12 march 2019) + Archives on Veterinary Science and Technology 3: 149.
  • Aliaga, B., I. Bulla, G. Mouahid, D. Duval and C. Grunau (2019) Universality of the DNA methylation codes in Eucaryotes. Scientific Reports 9: 173. DOI 10.1038/s41598-018-37407-8 / HAL
  • Chevalier, F. D., W. Le Clec’h, M. McDew-White, V. Menon, M. A. Guzman, S. P. Holloway, X. Cao, A. B. Taylor, S. Kinung’hi, A. N. Gouvras, B. L. Webster, J. P. Webster, A. M. Emery, D. Rollinson, A. Garba Djirmay, K. M. Al Mashikhi, S. Al Yafae, M. A. Idris, H. Moné, G. Mouahid, J. Hart, P. T. LoVerde and T. J. C. Anderson (2019) Oxamniquine resistance alleles are widespread in Old World Schistosoma mansoni and predate drug deployment. BioRxiv (657056 du 20/08/2019) + PLOS Pathogens 15(10): e1007881
  • Falaise, C., A. James, M. A. Travers, M. Zanella, M. Badawi and J. Mouget (2019) Complex Relationships between the Blue Pigment Marennine and Marine Bacteria of the Genus Vibrio.  Marine Drugs 17: 160-172. DOI 10.3390/md17030160 
  • Fallet, M., E. Luquet, P. David and C. Cosseau (2019) Epigenetic inheritance and intergenerational effects in mollusks. Gene 729: 144166. DOI 10.1016/j.gene.2019.144166 / HAL
  • Lerat, E., J. Casacuberta, C. Chaparro and C. Vieira (2019) On the importance to acknowledge transposable elements in epigenomic analyses. Genes (Basel) 10 (Special issue Epigenetics and Adaptation): 258. DOI 10.3390/genes10040258 / HAL
  • Loth, K., A. Vergnes, C. Barreto, S. N. Voisin, H. Meudal, J. Da Silva, A. Bressan, N. Belmadi, E. Bachère, V. Aucagne, C. Cazevielle, H. Marchandin, R. D. Rosa, P. Bulet, L. Touqui, A. Delmas and D. Destoumieux-Garzón (2019) The ancestral N-terminal domain of big defensins drives bacterially triggered assembly into antimicrobial nanonets. MBio 10: e01821-01819. DOI 10.1128/mBio.01821-19 / HAL
  • Lupo, C., M. A. Travers, D. Tourbiez, C. Barthélémy, G. Beaunée and P. Ezanno (2019) Modeling the Transmission of Vibrio aestuarianus in Pacific Oysters Using Experimental Infection Data. Frontiers In Veterinary Science 6: 15. DOI 10.3389/fvets.2019.00142 / HAL /
  • Mouahid, G., R. Mintsa NGuema, K. M. Al Mashikhi, S. A. Al Yafae, M. A. Idris and H. Moné (2019) Host-parasite life-histories of the diurnal vs. nocturnal chronotypes of Schistosoma mansoni: adaptive significance. Tropical Medicine and International Health 24: 692-700. DOI 10.1111/tmi.13227 / HAL
  • Picard, M. A. L., B. Vicoso, D. Roquis, I. Bulla, R. De Carvalho Augusto, N. Arancibia, C. Grunau, J. Boissier and C. Cosseau (2019) Dosage compensation throughout the Schistosoma mansoni lifecycle: specific chromatin landscape of the Z chromosome. Genome Biology and Evolution 11(7): 1909-1922. DOI 10.1093/gbe/evz133 / HAL
  • Picot, S., B. Morga, N. Faury, B. Chollet, L. Dégremont, M. A. Travers, T. Renault and I. Arzul (2019) A study of autophagy in hemocytes of the Pacific oyster, Crassostrea gigas. Autophagy 15: 1801-1809. DOI 10.1080/15548627.2019.1596490
  • Portet, A., S. Pinaud, C. Chaparro, R. Galinier, N. M. Dheilly, J. Portela, G. Charrière, J. F. Allienne, D. Duval and B. Gourbal (2019) Sympatric versus allopatric evolutionary contexts shape differential immune response in Biomphalaria / Schistosoma interaction. Biorxiv (378034) +  Plos Pathogens 15(3): e1007647. DOI 10.1371/journal.ppat.1007647 / HAL
  • Robino, E., A. C. Poirier, H. Amraoui, S. Le Bissonnais, A. Perret, C. Lopez-Joven, J.-C. Auguet, T. P. Rubio, C. Cazevielle, J. L. Rolland, Y. Hechard, D. Destoumieux-Garzón and G. M. Charrière (2019) Resistance of the oyster pathogen Vibrio tasmaniensis LGP32 against grazing by Vannella sp. marine amoeba involves Vsm and CopA virulence factors. Environmental Microbiology. DOI 10.1111/1462-2920.14770 / HAL
  • Roquis, D., A. Picart-Picolo, K. Brener Raffalli, P. Romans, P. Masanet, C. Cosseau, G. Mitta, C. Grunau and J. Vidal-Dupiol (2019) The tropical coral Pocillopora acuta has a mosaic DNA methylome, an unusual chromatin structure and shows histone H3 clipping. BioRxiv (722322v722321)
  • Rubio, T., D. Oyanedel-Trigo, Y. Labreuche, E. Toulza, X. Luo, M. Bruto, C. Chaparro, M. Torres, J. De Lorgeril, P. Haffner, J. Vidal-Dupiol, A. Lagorce, B. Petton, G. Mitta, A. Jacq, F. Le Roux, G. Charrière and D. Destoumieux-Garzón (2019) Species-specific mechanisms of cytotoxicity towards immune cells determine the successful outcome of Vibrio infections. Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA 116: 14238-14247. DOI 10.1073/pnas.1905747116 /HAL
  • Yonemitsu, M. A., R. M. Giersch, M. Polo-Prieto, M. Hammel, A. Simon, F. Cremonte, F. T. Aviles, N. Merino-Veliz, E. A. V. Burioli, A. F. Muttray, J. Sherry, C. Reinisch, S. A. Baldwin, S. P. Goff, M. Houssin, G. Arriagada, N. Vazquez, N. Bierne and M. J. Metzger (2019) A single clonal lineage of transmissible cancer identified in two marine mussel species in South America and Europe. eLife 8: e47788.
    DOI 10.7554/eLife.47788 / HAL

OUVRAGES

  • de Carvalho Augusto R., Cosseau C. and Grunau C. (2020) Measuring histone Methylome of the Human Parasite Schistosoma Mansoni. IN Barciszewski J. and Jurga S. The DNA, RNA, and Histone Methylomes. Springer: 607-624 (ISBN 978-3030147914)
  • Ali S.M., F. Allan, I. Ayi, F. Chandre, P. M. Z. Coelho, A. Garba, A. K. El-Hawary, J. Guo, D. Jian-Rong, C. Kariuki, H. Madsen, S. J. Mohammed, H. Moné, P. Müller, E. K. N’goran, R. Oxborough, D. Rollinson, W. Tian-Ping, R. S. Yadav, Z. Yi, Y. Zhang and X.-N. Zhou (2020). Utilisation sur le terrain de molluscicides dans les programmes de lutte contre la schistosomiase : un manuel pratique à l’usage des gestionnaires de programmes [Field use of molluscicides in schistosomiasis control programmes: an operational manual for programme managers]. Genève, Suisse, WHO. (ISBN 978-92-4-000045-2)
  • Boissier, J., G. Mouahid and H. Moné (2019). Schistosoma spp. IN J. B. Rose and B. Jimenez-Cisneros Global water pathogen project Part 4 Helminths. Michigan State University E. Lansing MI UNESCO.